科学家对伊比利亚ly x的基因组进行了测序 这是最濒危的猫科动物

放大字体  缩小字体 发布日期:2019-01-08 浏览次数:96

西班牙科学家对伊比利亚ly((Lynx pardinus)的基因组进行了测序,目前它是世界上最濒危的猫科动物之一。他们证实了其DNA所遭受的“极度侵蚀”。伊比利亚ly is拥有遗传多样性最少的基因组之一。它甚至不如其他濒临灭绝的哺乳动物,如猎豹或塔斯马尼亚恶魔,或鸟类,如朱i或鱼鹰。

科学家对伊比利亚ly x的基因组进行了测序 这是最濒危的猫科动物

这项研究发表在今天的科学期刊“ 基因组生物学”上,由Doñana生物站(CSIC)的科学家们协调。基因组监管中心(CRG)从一开始就为这个研究项目做出了贡献,包括几个小组和设施。特别是生物信息学和基因组学计划中的RodericGuigó,Cedric Notredame和ToniGabaldón的实验室以及CRG生物信息学部门。这是第一个完全在西班牙产生的哺乳动物基因组。

该项目由Banco Santander资助,由FundaciónGeneralCSIC管理,整合了来自12个机构的研究小组的50名科学家的努力,其中两个来自西班牙以外的国家,涵盖了广泛的学科,包括生物信息学,基因组学,肿瘤学。 ,进化和保护。

科学家们成功地阅读并组织了来自Candiles的24亿个DNA信件,这是一种出生在Sierra Morena lynx种群中的雄性ly ,,现在已成为圈养繁殖计划的一部分。为此,他们使用新的测序技术并开发了创新程序,以在有限的预算内生成高质量的草图基因组。

共鉴定出21,257个基因,其数量与人类和其他哺乳动物相似,并与猫,老虎,猎豹和狗进行了比较。具体而言,巴塞罗那基因组调控中心的ToniGabaldón小组将伊比利亚lynx基因组与其他物种的基因组进行了比较,试图找出失去其功能的基因,因为它们一直处于孤立状态,并且存在少量的标本。种类。研究人员已经发现了与听觉,视觉和嗅觉相关的基因修饰的证据,以促进ly to对环境的适应,这使得它们成为专门用作兔子猎物的特殊猎人。

伊比利亚ly path的历史和多样性

为了研究该物种的历史和遗传多样性,对来自Doñana和Sierra Morena的另外10只伊比利亚山猫的基因组进行了分析,这是伊比利亚半岛上仅有的两个幸存的种群,它们已经相互隔离数十年。 。研究人员还完成了与欧洲ly in的比较分析,以发现居住在欧亚大陆的两个ly in之间的联系。

大约30万年前,伊比利亚ly has开始偏离其姐妹物种欧亚ly(Lynx lynx),并且这两个物种在大约2500年前完全分离。在此期间,当气候学允许物种在伊比利亚半岛和欧洲南部相互传播和相遇时,它们可能继续交叉繁殖和交换基因,可能是在冰川之间。

伊比利亚ly in的人口历史以三次历史性衰退为标志,其中最后一次发生在大约300年前,人口大幅减少。除此之外,20世纪由于受到迫害,栖息地遭到破坏以及主要食物来源的兔子遭受的两次主要病毒流行,标本数量急剧下降。

科学家们已经将这些人口下降解释为观察到的低水平多样性的原因,并警告说这可能会削弱lynx适应其环境变化(气候,疾病等)的能力。此外,已经证实存在多种潜在有害的遗传变异体,这可能有助于降低物种的存活率和繁殖率。

这种遗传恶化在多纳纳群体中特别显着 - 较小,并且分离的时间较长 - 其中塞拉莫雷纳群体的遗传多样性的一半。然而,该研究反映了两个孑遗种群之间交换之前的情况,并开始了它们在圈养中的繁殖。这些措施是在伊比利亚ly x保护计划中采取的,近年来已导致物种遗传状况的改善。

在项目框架内使用新的基因组资源将有助于优化旨在保持最大遗传多样性的管理,同时尽可能减少这些种群的遗传缺陷。

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