新的基因检测技术提高了临床生物标志物的分析精度

爱沙尼亚科学家宣布发明了一种基因检测技术，该技术可以在单分子水平上分析临床生物标记物的数量，从而提高精密医学检测的灵敏度，并使其在未来更加经济实惠。正在申请专利的TAC-seq方法已经被用于生育诊所，以确定月经周期中适当胚胎移植的个体差异。

这种名为TAC-seq的新分子工程方法提高了生物标记物分析的精确度，并且有望使其更加经济实惠。该专利正在申请中的方法将于明年以子宫内膜容受性测试的形式引入医疗保健系统，商标为beREADY测试。

来自健康技术能力中心的爱沙尼亚研究人员与芬兰赫尔辛基大学塔尔图大学和瑞典卡罗林斯卡医学院合作，在Nature的合作期刊“ 基因组医学 ”上发表了一篇文章，其中作者通过测序证明了靶向等位基因计数( TAC-seq)及其几个潜在的应用。该方法以极高的精确度测量临床样品中用作生物标志物的DNA和RNA分子的数量，从而描述患者的健康状况。

生物标志物可以是任何分子，其存在或不存在是可测量的并且提供关于健康状态的信息。诊所使用数以千计的基于生物标记物的测试，其中许多测试分析DNA作为遗传和基因表达谱的代理。必须尽可能准确地对临床测试做出反应，并将测试定价在合理的水平。

根据生物信息学Hindrek Teder的塔尔图大学博士生的说法，新方法是反映患者实际情况的极其精确分析的关键。“通常在临床样本中，必须使用PCR方法扩增DNA，以确保用于下一代测序的材料，否则仪器无法测量。不知道给定原始分子产生了多少拷贝，因此结果是不准确的。另一方面，使用TAC-seq，我们看到原始数据没有信息丢失，并识别和删除实验室中制作的所有人工副本。结果是校正后的生物标记值反映了临床样本具有最大可靠性。“

本文介绍了该方法的三种可能的应用。首先，TAC-seq可用于子宫内膜容受性测试 - 确定特定RNA分子的水平，目的是确定将胚胎转移到接受不孕症治疗的女性的最佳时间，从而增加成功的可能性体外受精。其次，它可用于非侵入性产前基因检测(NIPT)，以研究女性血液中的无细胞DNA，以检测胎儿中最常见的染色体疾病。第三，该方法可用于在不同体液中进行精确的微RNA分析。这些分子可用作几种病症的生物标志物，因此放弃了进行令人不愉快和痛苦的活组织检查的需要。

“在生物标记物的实验室分析过程中，每个独特的分子都会得到一个所谓的分子条形码。具有相似代码的分子 - 通过PCR扩增在实验室中制作的拷贝 - 被发现并合并在一起。这使得它成为可能最小化技术偏差，这可能在实验室中放大材料时发生。分子条形码迄今已用于研究，但现在它已成为临床样本分析的标准，“Teder说，他也是第一作者。这篇文章与塔尔图大学分子与细胞生物学博士生Mariann Koel以及信息学Priit Paluoja硕士学位学生共同完成。

研究负责人，卫生技术能力中心的主要研究人员KaarelKrjutškov博士指出，TAC-seq方法最初是经过多年试验后实现的梦想。“有大量科学和高科技的遗传分析方法用于研究患者，但我们发现迫切需要一种超精确且价格合理的解决方案。本质上，TAC-seq是一项拓宽的遗传技术发明在实践中，子宫内膜容受性(beREADY)测试已经在临床验证中。该测试分析了57个关键的子宫内膜生物标记物，这些标记提供了体外受精胚胎转移到雌性等待的最佳日期的指示。怀孕。”

“作为一项开发活动，TAC-seq项目接近理想课程。首先我们进行了彻底的基础研究，然后我们申请了国际专利。现在我们已经公布了我们的结果，描述了该方法的各个方面的应用和最重要的是 - 这种方法已经融入医疗保健系统，“Krjutškov总结了漫长的开发过程。