美国能源部联合基因组研究所(DOE JGI)和环境分子科学实验室(EMSL)已接受了2014年合作科学倡议提案期间提交的12个项目。
协作呼叫为研究人员提供了一个独特的机会,将基因组学和分子鉴定的力量结合在一个研究项目中,以帮助推进能源部生物和环境研究办公室(BER)的使命。选定的研究人员将能够访问两个用户设施的功能。他们还将能够生成这两个设施独有的数据集 - 超出任何一个设施本身可以生成的数据集。
“这些批准的项目代表了生物地球化学,碳循环和生物燃料/生物产品生产研究的优秀横截面,”EMSL生物系统动力学和设计科学主题负责人Scott Baker说。“继续与JGI合作非常令人兴奋,我期待这些项目产生的见解和影响。”
接受的提案将于2014年10月1日开始,包括:
将微生物群落与地下水 - 地表水相互作用区中的碳和污染物生物地球化学相结合。PI-James Stegen,西北太平洋国家实验室
解码DOM降解:碳源和阳光暴露如何改变微生物代谢和基因组编码的永久冻土有机物代谢退化的表达?PI-Byron Crump,俄勒冈州立大学
解剖真菌木材腐烂的种内多样性。 PI-Ronald de Vries,CBS-KNAW真菌生物多样性中心
阐明工程化N-糖基化基序对细菌生物质水解酶的影响,以及对黑曲霉中异源和天然基因表达,分泌和降解的影响。 西北太平洋国家实验室PI-Jon Magnuson
微生物聚生体的综合生物地球化学模拟,介导动态甲烷水合物沉积物中甲烷的厌氧氧化。 PI-Frederick Colwell,俄勒冈州立大学
整合基因组/转录组学/分泌组学研究松树蘑菇属中松树与其共生的外生菌根真菌之间的植物 - 真菌相互作用。 杜克大学PI-Rytas Vilgalys
绘制植物 - 微生物共生中营养和碳交换的代谢。 西弗吉尼亚大学PI-Jonathan Cumming
深层地下页岩碳储层生物地球化学循环的微生物控制。 PI-Kelly Wrighton,俄亥俄州立大学
量化差异表达并识别产甲烷途径中的瓶颈。PI-Zaida Luthey-Schulten,伊利诺伊大学厄巴纳 - 香槟分校
通过外膜β-桶蛋白感应外部金属。 乔治亚理工学院PI-Thomas DiChristina
通过平行的高分辨率有机物质和微生物群落特征,解冻永久冻土融化过程中碳转化的系统级见解。PI-Virginia Rich,亚利桑那大学
揭示浮萍的水生微生物组的组成和功能。 田纳西大学PI-Sarah Lebeis