对多发性骨髓瘤的测序

一些遗传形式的癌症在家庭中存在，但是在生命中累积的基因组错误 - 例如那些因接触香烟烟雾中的化学物质，或者来自杂散的宇宙辐射，或DNA重复中的随机错误 - 是大多数肿瘤的原因。

这就是国家人类基因组研究所(NHGRI)于2005年与国家癌症研究所(NCI)合作推出癌症基因组图谱(TCGA)的原因，这是一项大规模的努力，旨在绘制最广泛认可的致病遗传变化图谱癌症，其中有200多种类型。

即使TCGA的工作取得进展，来自世界各地的其他研究团队也使用全基因组分析来追踪癌症的遗传根源。对于本月的March Genome Advance，NHGRI选择了一项研究，显示测序技术的力量如何产生了一个重要的发现，即使在研究相对较少的患者时，在这种情况下只有38. TCGA研究，另一方面手，包括500名患者在每种肿瘤类型的分析。

这项研究发表在2011年3月24日的“ 自然 ”杂志上， 描述了由马萨诸塞州剑桥市Eli和Edythe L. Broad研究所癌症项目负责人Todd R. Golub医学博士组织的全国性研究团队。关于多发性骨髓瘤的遗传原因，发现了一些新发现，这是一种目前无法治愈的癌症形式，它影响一种称为B淋巴细胞的免疫细胞。每年有超过20,000名美国人患上多发性骨髓瘤; 每年约有一半的人死于这种疾病。

研究人员在23名患者中进行了全基因组测序，并对16名患者进行了全外显子组测序，其中只对人类基因组的蛋白质编码区进行了测序。用这两种技术研究了一名患者。研究人员将每位患者肿瘤的DNA序列与正常DNA进行了比较。通过比较肿瘤DNA与正常DNA，研究人员发现每百万个DNA基因大约有2.9个突变。这导致整个基因组中有近7,500个点突变，其中35个突变蛋白质中的氨基酸，以及21个影响编码蛋白质区域的染色体重排。这些突变发生在C或G碱基(而不是As或Ts)的可能性要高出许多倍，并且在编码蛋白质(外显子)的区域与基因之间的内含子或区域相比较不常见。

在一种名为BRAF的酶中，一种特殊的突变可能会迅速导致现有的抑制BRAF的药物进行临床治疗; 然而，只有一小部分多发性骨髓瘤患者有这种突变。此外，在将近一半的患者中，研究人员发现了参与RNA加工，RNA转化为蛋白质以及随后蛋白质折叠的基因突变，为未来的治疗提供了许多可能的靶点。

研究人员写道，研究结果表明，测序研究将产生“对现有知识未预料到的癌症的新见解”。基因组学有可能对许多医学领域产生积极影响，但最直接的可能是更准确地诊断疾病，药物基因组学(为患者的DNA定制药物治疗)和癌症护理。