研究人员使用基因组学来区分两种卵巢癌亚型

提高女性卵巢癌存活几率是基因组研究的核心，它可以区分疾病的亚型。由国家人类基因组研究所(NHGRI)基因组技术研究所的研究人员领导的一个小组根据打开或关闭基因的信号区分了特定的卵巢癌亚型，这一过程称为DNA甲基化。研究结果发表在2012年3月5日的PLoS One上，可能导致卵巢癌肿瘤的精确分类，并改善治疗策略，他们说。

“这项研究使用基因组工具和分析方法重新审视了卵巢癌，”资深作者，NHGRI研究员Laura Elnitski博士说。“我们认识到从这种癌症的一种亚型到另一种亚型的明显差异模式，这是进行更准确的临床诊断并最终提供个性化癌症治疗的关键。”

卵巢癌是女性最严重的健康挑战之一，其特征是不受控制和异常的细胞生长，这是由正常DNA序列中突变的积累引起的。这些突变可以在基因和蛋白质中产生缺陷，健康基因会产生或干扰特定的生化过程 - DNA甲基化 - 可以打开或关闭基因。每年，美国有超过21,000名女性被诊断患有卵巢癌。由于几乎没有早期预警信号，五年生存率低于30%，全球每年有125,000名女性死于这种疾病。

NHGRI研究人员与华盛顿特区乔治华盛顿大学公共卫生与健康服务学院，芝加哥拉什大学和匹兹堡大学医学院的同事一起开展了最广泛的妇科癌症DNA甲基化比较研究。他们检查了近14,500个基因的启动子区域中超过27,500个甲基化位点。启动子区域是在控制基因表达中重要的DNA片段。

卵巢癌具有至少四种不同亚型的复杂化妆品，每种亚型在显微镜下具有独特的外观。研究人员分析了两种亚型的DNA甲基化模式。他们专注于浆液，最常见的疾病形式，子宫内膜样，这是另一种侵袭性类型，与子宫内膜中的肿瘤特征相似。尽管治疗选择已经扩大并且对于卵巢癌变得越来越复杂，但是浆液性和子宫内膜亚型被视为并且被视为单一疾病。

研究人员将浆液性和子宫内膜样卵巢肿瘤与来自输卵管和子宫内膜的健康组织以及子宫肿瘤进行了比较。此外，他们利用来自癌症基因组图谱的浆液性肿瘤和健康输卵管组织的甲基化数据，该组织由NHGRI和国立卫生研究院的国家癌症研究所联合发起。

研究人员利用对大量组织类型和靶向基因进行分析所产生的数千个数据点的计算分析，寻找甲基化模式以在其基因组数据中形成。他们发现甲基化改变的模式与不同的癌症类型相吻合。

例如，子宫内膜样肿瘤在基因启动子区域中显示出广泛的积累和甲基化的丧失，这反映了模式的有缺陷的维持。在结肠癌和肝癌中已经观察到类似的DNA甲基化累积，并且已知为甲基化表型。

子宫内膜样肿瘤进行非常相似的改变，无论它们是否出现在卵巢或子宫中。相比之下，浆液性肿瘤的甲基化模式更像正常细胞，甲基化水平与子宫内膜样肿瘤相比不那么一致。