首次整合人原代细胞中microRNA表达的图谱

尽管个体的几乎所有细胞的基因组序列是相同的，但人体由数百种具有不同功能和行为的不同细胞类型组成。细胞功能作用的变化是由一个复杂的调节网络完成的，该调节网络由调节蛋白以及调节RNA如微小RNA组成。这种网络的失调在疾病发展中起主要作用，特别是在癌症中。

由RIKEN领导的国际科学联盟FANTOM现在已经在人类原代细胞中创建了第一个microRNA表达的广泛图谱。利用作为第五版FANTOM的一部分建立的RNA样本的收集，该团队对数百个人类样本的microRNA文库进行了测序，包括许多以前从未研究过microRNA存在的细胞类型。

在FANTOM项目的早期阶段，每个样本都使用Cap Analysis Gene Expression(CAGE)进行分析，这是RIKEN开发的一种技术，用于发现RNA的精确起始位点。将CAGE数据与microRNA数据相结合，使团队能够创建microRNA表达的综合图谱以及控制不同细胞类型中microRNA表达的基因组区域图谱。总之，这些数据集首次提供了这些调节器如何有助于建立人体中每种细胞类型的独特身份。

在Nature Biotechnology上发表的研究中，科学家们发现，本研究中鉴定的microRNA基因组控制区在进化过程中高度保守，强调了它们在细胞调控中的重要性。研究人员还发现了数千个新的基因组位点产生短RNA，这可能证明是一类新的调控短RNA。

RIKEN生命科学技术中心的Michiel de Hoon说：“我们已经在网上提供了表达图谱，并期望在全世界拥有数千名用户。我们相信它将成为了解microRNA监管及其作用的重要资源。在人类疾病。“