晶体结构揭示了非标准RNA转录的细节

高分辨率晶体结构揭示了在非传统转录形式期间RNA的新途径 - 从DNA模板产生RNA的过程。在重复转录过程中捕获，这是一种转录形式，其中单个DNA碱基(由字母A，T，C和G表示)编码RNA中的几个相应碱基(DNA中的一个G导致几个Gs)例如，在RNA中，新的晶体结构揭示了通过替代通道离开聚合酶的RNA，以实现这种非传统的转录模式。描述宾夕法尼亚州立大学和阿拉巴马大学伯明翰分校研究小组发现的论文发表在“美国国家科学院院刊”上。

“在X射线晶体学的经典观点中，你会认为酶-RNA 聚合酶将被灭活，我们无法在结晶状态下捕获生化过程，”生物化学教授Katsuhiko S. Murakami说。和宾夕法尼亚州的分子生物学和该论文的作者。“但在包括我们在内的一些系统中，RNA聚合酶仍然存活，因此我们可以在制造RNA的过程中监测结构。”

宾夕法尼亚州立大学和诺贝尔化学奖得主保罗·伯格在20世纪60年代早期在斯坦福大学的名誉主席罗伯特W.和Vivian K.卡希尔退休教授中发现了重复转录。尽管将DNA序列准确地转录成RNA可能看起来是一个简单的错误 - 当RNA链相对于聚合酶内的DNA链滑动时，发生重复转录 - 它在细胞中起作用。重复转录在控制许多基因的基因表达中起着关键作用，但尽管有这一重要作用，其机制仍然是一个黑盒子。

“我们的工作扩展了我们对RNA转录所涉及的分子机制的灵活性的理解，”宾夕法尼亚州立大学研究助理兼该论文作者Vadim Molodtsov说。“通过在重复转录过程中捕获RNA聚合酶的晶体结构，我们能够确定RNA用于退出酶的新途径。它不是通过门进入，而是偷偷溜出窗外。”