RNA发现可以改善干细胞研究

发现最近描述的与基因表达密切相关的各种RNA主要是细胞类型特异性的，这提高了这种RNA序列可能能够用作干细胞研究中的标记的可能性。该研究发表在Nature Structural and Molecular Biology上，由Vasil Galat博士，病理学研究助理教授共同撰写。只有大约20%的RNA代码用于蛋白质，剩下的80%被称为非编码RNA，被认为参与了多种细胞过程，包括RNA翻译，剪接和DNA复制。

非编码RNA可以进一步分为微RNA和长非编码RNA，超过一半的长非编码RNA是富含染色质的(cheRNA)，其中染色质环绕RNA链，然后被RNA聚合酶结合根据之前的研究，II位于基因启动子附近。据Galat称，这种物理接近转化为功能连接。

在目前的研究中，Galat和该研究的其他共同作者发现，cheRNA序列也与不同类型的细胞最终的遗传表达特异性相关。“因为它们与启动子区域有很好的联系，它们可以用作启动子区域特定基因的预测因子，”Galat说。“一旦你看到表达的cheRNA，就可以判断出基因的位置。”

据加拉特说，生物学家目前使用几种方法来定位基因启动子区域，但这种方法可能更加可靠和精确。现在，cheRNA是细胞类型特异性的发现在他的主要研究领域中具有特别诱人的应用：多能干细胞。

多能干细胞是未分化的，这意味着它们可以发育成人体中几乎任何类型的细胞。将它们保持在多能阶段可能会很棘手，这就是为什么加拉特实验室被邀请与芝加哥大学领导的项目合作。“我们的实验室在处理多能细胞方面拥有丰富的经验，”Galat说。“这些细胞需要经验来维持。它们在培养中一直在自发地区分。”

从理论上讲，通过建立细胞类型和相关cheRNA的数据库，cheRNA可以用作标记来缩小多能干细胞正在转化的细胞类型- 使用现有设备的艰巨任务。“许多类型的细胞在文化上都看起来非常相似，”加拉特说。“你可以检查标记，但许多标记重叠 - 所以区分细胞类型你必须使用许多标记。相反，如果你可以分离cheRNA，它可以定义你正在处理的细胞类型和功能成熟它们是如何“。

他甚至希望科学家能够在未来的某个时刻使用cheRNA来积极指导分化。

更精确地操纵多能细胞可以加速具有特定功能的基因工程细胞的过程 - 例如，产生免疫系统的高功能细胞，其几乎涉及健康的每个方面。“这是cheRNA最有趣的特征，”Galat说。“它可以作为表征细胞类型的一种方式，也可以作为指导多能细胞发育成特定细胞类型的方法。”