疟原虫寄生虫的快速DNA分析

抗击疟疾的斗争正在加剧。现在，一项新技术使生物学家能够比以前更快地操纵导致疟疾的寄生虫的基因40倍。结果报告在 Nature Methods中。

希望制造针对疟疾的药物和疫苗的生物学家研究模型生物体 伯氏疟原虫(Plasmodium berghei)，它是人类疟疾引起的寄生虫的近亲，它在蚊子和啮齿动物之间传播。 P. berghei有大约5,000个基因，定义每个基因的功能应该有助于确定疟疾寄生虫的跟腱，英国剑桥Wellcome Trust Sanger研究所的生物学家Julian Rayner说。

然而，分析这些基因的标准技术很慢。生物学家使用酶来复制寄生虫基因的片段，然后对其进行变异以了解去除或破坏基因以确定基因功能的后果。将这些DNA片段储存在 大肠杆菌中，直到它们准备好重新引入寄生虫中。但是，它们结构圆形，性质脆弱。细菌拒绝任何破碎的DNA线圈。

该团队包括来自沙特阿拉伯Thuwal的阿卜杜拉国王科技大学(KAUST)的生物学家Arnab Paint，通过设计大肠杆菌宿主可以耐受的非环状DNA载体解决了这个问题 。

他们还使用了2011年初开发的一种技术，该技术利用部分感染细菌的病毒来切割，修饰和重组DNA，同时将载体置于 大肠杆菌中。“而不是在实验室的试管中做到这一点，经常失败并引入很多错误，我们操纵 大肠杆菌的机器为我们做的更准确，”团队成员Oliver Billker，也是桑格研究所。

这些方法将允许团队在8天内制作96个载体 - 这是以前需要一年的壮举。他们现在计划建立一个覆盖寄生虫整个基因组的载体库，供广泛使用。