聚酮化合物是一大类次级代谢产物,已成为现代医学中不可或缺的。它们由称为聚酮化合物的大量酶制成,其含有多个催化结构域,每个催化结构域可以以不同的方式改变聚酮化合物分子。
从分子主体分支出来的聚酮化合物侧链表现出大量的结构多样性,单靠聚酮化合物的作用无法解释。然而,最近的研究表明,一类叫做巴豆酰辅酶A羧化酶还原酶(CCRs)的酶可能参与聚酮化合物的延伸。
德国萨尔布吕肯萨尔大学的RolfMüller和包括伊拉克库尔德斯坦高野大学Schwan Rashid在内的国际研究团队从细菌物种Streptomyces sp中分离出一种名为己基丙二酰辅酶A合酶的CCR 。JS360。
该团队是第一个将与其底物结合的酶结晶,这种小分子加入到它催化的聚酮化合物中。然后,他们使用X射线衍射确定其原子级细节的结构,准确显示酶如何结合其底物。他们的研究结果发表在 Nature Chemical Biology上。
该研究还鉴定了两个氨基酸残基,其负责酶对底物的特异性。
通过产生酶的突变形式,研究人员还表明,这两个残基对于结合二氧化碳是至关重要的,二氧化碳是扩展聚酮化合物所必需的。
“我们的研究结果可能会导致有意改变和改善聚酮化合物用于临床应用的方法,”Müller说,“我们现在正在进行酶的机械和突变研究。”