特定癌症中发现新型生物标志物

冷泉港实验室(CSHL)的科学家已经确定了一类特定的生物标志物，可以说明患者癌症的侵袭性。“毫无疑问，几十个或几百个突变导致癌症，几乎可以在任何肿瘤中找到，”CSHL研究员Jason Sheltzer博士说。“这就是为什么令人惊讶地发现这些突变在早期良性癌症以及真正具有攻击性，高度恶性的癌症中均匀分布。”换句话说，导致癌症的突变实际上并没有告诉你关于谁将最终存活以及谁将最终死于癌症的事情。

这就是为什么Sheltzer博士开始寻找可以确定癌症患者预后的其他易于识别的因素。根据eLife发表的一篇论文(“与癌症患者预后相关的突变和拷贝数改变的系统鉴定”)，他的团队不仅追踪每位患者的结果 - 无论是恢复还是悲剧 - 而且还仔细研究了基因位点通常与致癌突变相关。“癌症的成功治疗决策取决于对患者风险的准确评估。为了提高我们对致命恶性肿瘤的分子改变的理解，我们分析了已知结果患者的17,879例肿瘤的基因组谱。我们发现几乎所有癌症驱动基因的突变都包含非常少的患者预后信息。然而，这些相同驱动基因中的拷贝数改变(CNA)具有显着的预后能力。研究人员写道，当控制分期，分级，TP53状态和完全非整倍性时，局灶性CNA与更广泛的改变相关，并且许多驱动基因中的CNA仍然是预后。“通过对独立患者队列进行荟萃分析，我们确定了特定癌症类型中强大的预后生物标志物，并且我们证明这些变化的一部分也赋予了特定的治疗漏洞。总之，我们的分析为癌症生物标志物鉴定建立了全面的资源，并强调了基因拷贝数分析在评估临床风险中的重要性。““虽然良性和侵袭性肿瘤的突变类型没有太大差异，”Sheltzer博士说，“当我们观察这些相同基因的拷贝数变化时，我们发现了非常显着的差异。”

通常，人类细胞中的遗传信息分布在23对染色体中的两个拷贝中。然而，癌细胞经常获得或失去染色体。

Sheltzer博士解释说：“许多癌症而不是基因的两个拷贝，将有三个拷贝，四个拷贝，五个拷贝，或者只有一个拷贝的基因。” “我们研究了这些拷贝数改变与癌症患者发生的关系之间的关系，并发现了一种强烈的关系。”

他现在希望开展一项前瞻性分析，在诊断后多年密切研究新的癌症患者。这可以突出显示哪种类型的拷贝数变化与哪些结果相关联。“这将是我们学习所学知识并将其转化为临床有用工具的第一步，也可以让患者安心，”Sheltzer博士说。