研究人员对莫哈韦沙漠龟的基因组进行序列分析

亚利桑那州立大学领导的科学家团队对莫哈韦沙漠龟(Gopherus agassizii)的基因组进行了测序，这是一种原生于莫哈韦沙漠的长寿物种。结果可以帮助动物在越来越多的威胁中存活下来。

莫哈韦沙漠龟是估计在大约3500万年前在北美出现的六种沙漠龟之一，可以在加利福尼亚州，内华达州，犹他州和亚利桑那州找到。

这种物种也被称为Agassiz的沙漠龟，受到栖息地丧失，呼吸道疾病和其他人为因素的严重影响。例如，该物种的一个区域的密度从1979年的约225个/ km2下降到1992年的约75个/ km2。

根据美国濒危物种法案，莫哈韦沙漠龟被列为“受威胁”，被国际自然保护联盟(IUCN)认为是“脆弱的”。

为了帮助保护该物种的遗传多样性，亚利桑那州立大学教授Kenro Kusumi及其合作者创建了一个全基因组参考序列，其基于成体骨骼肌，肺，脑和血液的深度转录组序列进行了注释。

“莫哈韦沙漠龟基因组是保护这一物种的重要资源，特别是因为这一群体患有严重疾病，”共同作者Marc Tollis博士说，他也来自亚利桑那州立大学。

“研究人员还没有完全了解它的原因或是什么让龟易受它影响。”

“解码这个基因组将帮助我们编制哪些龟基因正在迅速发展以帮助它们克服这种威胁。”

研究人员获得了特定乌龟标本的遗传数据，汇集并注释了基因组，并了解了陆龟的进化历史。

“解码基因组在技术上变得更加容易，”库苏米教授说。

“现在最具挑战性的是解码乌龟基因组中的信息。我们可以使用与小鼠和人类基因组相似的线索。“

“在大海捞针中寻找众所周知的'针头'将是识别导致免疫反应传染病的基因，以及在莫哈韦沙漠的恶劣条件下生存的能力。”

“我们必须了解龟类多样性在其地理范围内的位置，”他补充说。

“确定遗传多样性的热点有助于从保护的角度管理物种，并保护龟类种群，以便在未来几年内更好地应对未知挑战。”

该团队还在分析莫哈韦沙漠龟及其姊妹物种索诺兰沙漠龟(Gopherus morafkai)之间的遗传差异。

“我的希望是，这项研究将使其他机构能够提出新问题，这些问题是他们在没有这项研究的情况下无法提出的问题，”共同作者，亚利桑那州立大学的Greer Dolby博士说。

“例如，'陆龟有什么免疫基因可以对抗病原体?他们的免疫系统如何在具有大量威胁的环境中发挥作用?而且，不断变化的环境会如何影响这个?这些是管理物种时需要回答的重要问题。现在，我们可以开始调查了。“