对人体血液中循环的DNA片段的一项新调查表明,生活在我们体内的细菌和病毒比以前所知的更加多样化。事实上,超过50%的DNA从未见过。
斯坦福大学的资深作者斯蒂芬雷克教授说:“我们发现了与人们以前见过的东西相关的东西,我们找到了不同的东西,我们发现了一些完全新颖的东西。”
Quake教授及其同事收集并分析了188名患者(156名心脏,肺和骨髓移植受者,32名孕妇)的样本。
在该团队收集的所有非人类DNA片段中,52%未能与现有基因数据库中的任何内容相匹配。
“通过对1,351个独立样本血液中循环无细胞DNA的大规模鸟枪测序,我们发现了数百种新的细菌和病毒,它们代表了以前身份不明的人类微生物组成员,”作者说。
“分析血液样本的累积序列数据使我们能够组装7,190个大于1 kbp的连续区域,其中3,761个是新的,在任何现有数据库中很少或没有序列同源性。”
神秘DNA中的“绝大多数”属于一种名为Proteobacteria的门,其中包括许多其他物种中的病原体,如大肠杆菌和沙门氏菌。
扭矩teno病毒(TTV)家族中以前未识别的病毒,通常与疾病无关,但经常在免疫功能低下的患者中发现,构成最大的一组病毒。
“我们通过这项工作将该家族中已知病毒的数量增加了一倍,”Quake教授说。
“也许更重要的是,我们发现了一组全新的TTV。”
“在众所周知的TTV中,有一组感染人类,另一组感染动物,但我们发现的很多都不适合任何一组。”
“我们现在已经发现了一类全新的人类感染类型,它们更接近动物类而不是之前已知的人类类型,因此在进化规模上非常不同,”他补充道。