Axolotl基因组测序

一个国际研究小组成功地对墨西哥蝾螈(Ambystoma mexicanum)的基因组进行了测序，组装和分析，这是一种神秘的蝾螈类生物，具有非凡的再生能力。

Axolotls仅在墨西哥中部，墨西哥城的南部边缘，在霍奇米尔科附近的运河和湿地中闻名。它们并非在它们的范围内均匀分布，而是聚集在特定的地方。

它们的平均长度为9英寸(20厘米)，但长度可达18英寸(45厘米)。

Axolotls是新生的水生蝾螈，意味着它们在成年，繁殖状态下保留了某些幼虫特征。它们具有从头部后面延伸到通气孔的尾鳍，并且永远不会丢失它们的鳃，使它们永久保持在水下。

动物也是独特的，因为它们可以再生四肢，包括不那么重要的大脑部分。

“为了充分了解再生并找出其在大多数物种中如此有限的原因，科学家们需要获得基因组数据来研究基因调控和进化，”奥地利维也纳分子病理学研究所的Sergej Nowoshilow博士解释说。和共同作者。

“到目前为止，由于其庞大的规模，蝾螈基因组已经避免了完整的装配 - 在320亿碱基对，它比人类基因组大10倍以上。”

“使用现有工具的序列组装过程被这个基因组中大量重复序列所困扰。”

Nowoshilow博士及其同事是第一个对蝾螈基因组进行测序和分析的研究，蝾螈基因组是有史以来最大的基因组。

作者解释说：“使用PacBio平台，一种产生长读数以跨越大型重复区域的测序技术，总共72.435.954个读数被测序。”

“对基因组的分析揭示了几个似乎指向动物独特性的特征，”他们说。

“我们发现仅存在于蝾螈和其他两栖动物物种中的几种基因在再生肢体组织中表达。”

“最引人注目的是，一种名为PAX3的基本发育基因在基因组中完全缺失，其功能已被另一种称为PAX7的基因所接管。”

“这两种基因在肌肉和神经发育中起着关键作用。”

Nowoshilow博士补充说：“我们现在掌握了地图，以研究腿部等复杂结构的重建方式。”

“这是使用axolotl的科学家群体的转折点，这是150多年前开始的一项研究冒险的真正里程碑。”