海洋中发现的新型病毒

一种病毒主导水样来自世界上的海洋一直逃分析因为它有特点,标准测试无法检测。然而,麻省理工学院和阿尔伯特·爱因斯坦医学院的研究人员已经设法隔离并研究这些难以捉摸的病毒的代表,提供病毒进化的关键缺失的环节,发挥着重要的作用在调节细菌种群,一项新的研究报道。

病毒的主要捕食者是细菌,细菌病毒的研究结果表明,当前视图的多样性有一个很大的盲点。通过详细分析这些结论出现了海洋样品由麻省理工学院博士后凯瑟琳·考夫曼,土木与环境工程教授马丁•Polz Libusha凯利的阿尔伯特·爱因斯坦医学院的教授,9人。结果被报道在本周《自然》杂志上。

新发现的病毒缺乏“尾巴”上发现大多数编目和测序的细菌病毒,和其他几个不同寻常的特性,导致错过了之前的研究。纪念这一事实,研究者命名这个新的集团Autolykiviridae-after字符来自希腊神话传奇难以捕捉。,不像典型的捕食的病毒只是一个或两种类型的细菌,这些无尾的品种可以感染几十种不同的类型,往往不同的物种,强调生态相关性。

这项研究“打开新途径,促进我们对角色的理解病毒的海洋,”杰德Fuhrman说McCulloch-Crosby椅子南加州大学海洋生物学,他并没有参与这项工作。”在实际意义上,它还表明,我们需要改变一些常用方法为了捕捉这些病毒的各种研究,”他说。“我认为这是一个重要的进步。”

当前的环境模型病毒———交互是基于研究跟踪病毒,考夫曼说,所以他们可能会丢失在本质上发生相互作用的重要方面。

“我们已经知道病毒是非常重要的,”考夫曼说,他指的是海洋表面,研究者的样本了,大约有1000万中发现的病毒是每毫升的水。Polz说,“大多数的病毒在实验室学习反面,大多数的海洋不。”所以研究小组决定研究无尾的病毒的一个子集,这称为弧菌感染的细菌。广泛的测试后,他们发现“,这些感染异常大量的主机,”他说。

测序Autolykiviridae代表后,研究人员发现”他们的基因组非常不同于其他病毒,“Polz说。首先,他们的基因组非常短:大约10000基地,而典型的40000 - 50000跟踪病毒。“当我们发现的时候,我们很吃惊,”他说。

新的序列信息,研究人员能够梳理数据库和发现这种病毒存在于很多地方。这项研究还显示,这些病毒往往是弱势的数据库,因为通常在实验室处理样品的方法。团队开发的方法从环境样品可以帮助研究人员获得这些病毒在未来避免这种损失的信息。此外,考夫曼说,一般情况下,研究者测试病毒活动是由感染细菌的病毒样本,然后检查样品一天后寻找迹象表明补丁的细菌被杀死了。但这些特定nontailed病毒往往较为缓慢,行事和杀死了区域不出现,直到几天之后他们的存在从来没有注意到大多数的研究。

新群病毒可能尤其普遍。“我们不认为这是ocean-specific,“Polz说。例如,病毒在人类的生物群落,甚至可能普遍主要生物地球化学循环和他们可能起到一定的作用,他说,比如碳的循环。

论文研究的另一个重要方面是,Autolykiviridae被证明是一个古老的病毒家族的成员定义为特定类型的衣壳,蛋白质外壳将病毒DNA。虽然这血统是非常不同的动物和protists-and包括腺病毒等病毒感染人类,和巨大的病毒感染algae-very很少发现这种病毒感染细菌。