当您想到DNA时,您可能会想到着名的双螺旋结构,这种梯状结构像开瓶器一样优雅地扭曲。
但DNA并不总是采用这种形式。人类中存在一种形状的DNA,特别是四链结构的遗传密码 - 多年来一直引起科学家们的争议。因为这种所谓的i-motif喜欢酸性环境(科学家可以在实验室中创造但不会在体内自然产生的条件),许多科学家认为它不可能存在于人体细胞中。
但是近年来,研究已经指出这种奇异形式的DNA实际上可能存在于活着的人类中。现在,今天(4月23日)发表在“自然化学”杂志上的一项新研究提供了第一个直接的证据,证明它确实存在,并且可能在调节我们的基因方面发挥重要作用。
“在此之前,DNA可以[像这样折叠]是一种学术观点,但它根本不为生物学所知它是什么,”高级研究作者,Kinghorn临床基因组学中心负责人Marcel Dinger说。在悉尼加尔万医学研究所。他说,看着这些i-motif出现在活细胞中“非常壮观”。
为了发现i-motif,Dinger和他的团队设计了一种抗体 - 一种针对体内外来入侵者的蛋白质 - 专门发现并锁定i-motifs。他们用荧光染料标记这些抗体,然后在实验室中将它们注射到人体细胞中。使用强大的显微镜,他们发现了一堆微小的,发光的,绿色的点状抗体,可以抓住难以捉摸的i-motif。
根据Dinger的说法,发表这篇论文最困难的部分是证明抗体只能锁定在i-motifs而不是其他形状的DNA上。他们通过测试抗体如何与其他形式的DNA相互作用来做到这一点,例如经典的双螺旋和与i-motif相关的更好研究的结构,称为G4四链体。果然,抗体被证实是忠实的 - 它不会与这些其他形式中的任何一种结合。
“这是一个非常令人兴奋的发现,”英国东英吉利大学化学生物学高级讲师Zoe Waller说,他没有参与这项研究。“这项工作正在为这些[DNA形式]确实在体内存在 并且值得进一步研究的大量证据提供支持 。”
在监管中的作用
Dinger告诉Live Science,让团队真正着迷的不仅仅是这些i-motif存在于活细胞中,而且这些绿色灯光闪烁着 - 这意味着i-motif折叠成存在然后反复展开。特别是,研究人员发现DNA在转录的特定阶段以较高的速率折叠成i-基序 - 这一过程将基因翻译成蛋白质 - 当DNA刚刚开始积极转录时。后来,DNA展开回到通常的状态,i-motif消失了。根据Dinger的说法,这可能意味着i-motif在调节转录过程中起着非常特殊的作用。
实际上,这项研究支持以前在实验室培养皿中的研究,即这些折叠发生在调节基因的区域。这些区域包括称为“ 端粒 ” 的染色体的末端,被认为在衰老中起作用,而区域称为启动子,其任务是打开和关闭基因。
但是,尽管知道这些折叠可能出现的某些区域,研究人员还不知道折叠控制哪些基因或当您扰乱细胞时会发生什么,从而无法形成这些结构。
“有很多我们不了解的基因组,可能就像它的99%,”Dinger说。在活细胞中看到像这样折叠的DNA“可以解码基因组中的那些部分,并了解它们的作用。”
事实上,这些奇怪的褶皱可能存在于我们的每一个细胞中,Dinger说。他说,与正常形状的DNA相比,由于基因组的折叠次数较少,因此与非折叠区域相比,靶向DNA的药物可以更具特异性地结合。
例如,这些类型的药物可能有助于癌症治疗。亚利桑那大学教授,Reglagene的首席科学官Laurence Hurley表示,某些癌症治疗方法存在的一个问题是,他们没有足够的选择性来定位有问题的DNA片段.Reglagene是一家设计治疗性分子的公司 - 像i-motifs一样的链DNA。相反,癌症药物也可能附着在DNA的其他部分,导致可能有害的副作用,Hurley说,他不是新研究的一部分。
“我一直在等待这样的论文出来很长时间,”赫尔利告诉Live Science。“这为围绕这些新结构的重大治疗努力提供了坚实的基础,并且消除了人们对这些结构是否真实并具有任何生物学意义的怀疑。”