新技术绘制了人体肠道中糖降解细菌的基因组图谱

发布日期：2018-12-02 浏览次数：55

生物信息学1中报道的一种新设计的计算机工具可以自动识别人肠道细菌中特定的酶编码基因位点。这种基因位点称为多糖利用基因座(PUL)，它编码细菌酶，分解人体肠道中复杂的膳食糖。

人类只能消化少量的膳食糖，如淀粉，蔗糖和乳糖。其他糖类如木聚糖，果胶，琼脂糖和层粘连蛋白被数以万亿的肠道细菌分解。如果这种细菌的活动被破坏，这会损害营养，影响人类健康。

新技术绘制了人体肠道中糖降解细菌的基因组图谱

为了更好地了解肠道活细菌在人类健康和营养中的作用，法国国家科学研究中心和沙特阿拉伯国王阿卜杜勒阿齐兹大学的研究小组开发了一种基于两口井PUL实验数据的计算机工具。 - 人类肠道细菌 -拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)和拟杆菌(Bacteroides ovatus)。他们应用该工具仅通过扫描细菌基因组来探测65种人肠道细菌中的PUL和来自环境的两种细菌。

研究人员确定了3,745个PULs，编码超过7,300种酶，如糖苷水解酶和多糖裂解酶。

“这表明对细菌基因的选择压力，这些基因编码一起协同降解肠道内复杂糖类的酶，”一项旨在分析中间人和动物消化微生物群的合作研究项目的首席研究员Bernard Henrissat说。东。