重建深人口中美洲和南美洲的历史

我们报告全基因组古DNA从49个人形成四个平行时间横断面在伯利兹,巴西、中央安第斯山脉和南锥,每个可以追溯到至少9000年前∼。的祖先群体辐射迅速从早期的两个分支,导致今天的印第安人。我们之前从未见过文档两个流北美和南美之间的基因流动。影响中央安第斯山脉的∼4200年前,而另一解释北美最古老的基因组之间的亲和力与克洛维斯文化和最古老的中部和南部的美国人从智利,巴西,和伯利兹。然而,这并不是后来南美的主要来源,随着其他古代个人来自血统没有特定亲和力Clovis-associated基因组,建议至少在9000年前开始的人口置换,紧随其后的是大量人口连续性在多个区域。

人类学

介绍

基因研究的现代和古代印第安人表明,绝大多数在美国非北极原住民源自祖先的齐次祖先的人口。这人口的多样化17500 - 14600日历年礼物(BP)(Moreno-Mayar et al .,2018 a

)分为两个分支,被称为“南方印第安人”或“祖先”(ANC-A)和“北部印第安人”或“B祖先”(ANC-B)(Moreno-Mayar et al .,2018 A

Raghavan et al .,2015

拉斯穆森et al .,2014

,2012年帝国等。

,斯盖布et al .,2018

)。个人约会从Anzick∼12900 - 12700 BP与克洛维斯文化相关的网站在蒙大拿和ANC-A血统,也很大程度反映在今天的中部和南部的美国人在古老的加州人。相比之下,ANC-B祖先严重代表在北美东部和古人从安大略西南部(斯盖布et al .,2018

)。原始记录的研究这两个深血统适合模型完全ANC-A中部和南部的美国人的祖先(Rasmussen et al .,2014

,2012年帝国等。

)。然而,斯盖布et al .(2018)

建议所有美国中部和南部港口大量比例的血统(至少每个∼30%)。

最近的分析也表明,一些组织在巴西和澳洲人分享更多的等位基因(新几内亚土著,澳大利亚人,安达曼群岛岛民)(Raghavan et al .,2015

Skoglund et al .,2015

来自中国北方的)和一个∼40000个基点个人(杨et al .,2017

)比其他中部和南部的美国人。这样的模式表明,这些团体并不完全来自一个同质性,而是源于人口的混合物,其中,人口Y,生了一个独特的澳洲人的亲和力。值得注意的是,我们的研究包括数据从个人如拉做圣网站有颅形态被称为“Paleoamerican”认为,表示两个不同的New-World-founding人口(冯Cramon-Taubadel et al .,2017

)。这里,我们直接测试的假设Paleoamerican颅形态与血统不同导致的其他印第安人(无论该人口Y或其他)。

本研究前,公布的数据来自中美洲和南美洲最后一年以上仅限于两个低覆盖率的基因组(Raghavan et al .,2015

)。在这里,我们报告全基因组数据从伯利兹49个人,巴西,秘鲁,和南锥(智利和阿根廷),41岁以上1000年,每一次横断面开始在10900 - 8600个基点(图1;表S3)。获得这些数据,我们与政府机构和土著人民合作,确定样品,准备从骨骼材料,提取DNA(Dabney et al .,2013

),生成单和双链DNA库,其中大部分我们对待酶uracil-DNA糖基化酶(UDG)减少特征的古代DNA错误(Gansauge和梅耶,2013

Rohland et al .,2015

)。我们为mtDNA丰富,∼120万个snp(Fu et al .,2015

)和测序的丰富图书馆Illumina公司仪器(表S3;星方法)。我们结合古代和现在的数据来研究基因变化在过去的11000年。