科学家们呼吁在3D基因组和表观遗传数据中统一标准

就像世界地图不仅仅是一个地方和街道名称列表一样，基因组不仅仅是一串字母。蛋白质和核酸的复杂编排在DNA中随时间差异地相互作用，因此细胞可以在发育和细胞分化期间或响应于生理和环境方面选择性地管理遗传信息。

世界各地的科学家正在开发新技术并在理解核的三维组织动力学方面取得进展。这种新方法将使研究人员能够绘制细胞类型之间的差异，探索基因表达如何在健康或疾病中发挥作用，并发现DNA功能是如何实现的，即使它被包裹在微小核内。

“我们知道基因组折叠及其动力学调节基因表达，新技术使我们能够建立3D模型来研究这些变化，目前正在动摇基因组研究并提高我们对细胞核复杂性的理解，”Marc A. Marti-解释说。 Renom，ICREA西班牙巴塞罗那基因组监管中心(CGAG-CRG)的国家农业研究中心(CNAG-CRG)研究员。“这是一个绝对有前途的领域，我们想要求标准，因为方法的快速发展和数据日益复杂化带来了许多必须立即解决的挑战，”他说。

在最新一期“自然遗传学”(Nature Genetics)上发表的一篇观点文章中，动力学和结构基因组学领域的顶尖科学家们一直在呼吁建立三维基因组和表观遗传数据标准。他们描述了该领域的主要挑战，并提供了思考4D核小体数据集和模型共享标准化验证策略的指南。

本文介绍了他们在4D Nucleome Initiative中的经验，作为欧洲新的FET-Flagship的LifeTime计划的一部分，以了解基因组如何在细胞内发挥作用，以及当组织向疾病进展时，细胞如何形成组织并动态地重塑其活动。

随着标准的呼吁，巴黎居里研究所的国际专家，爱丁堡大学遗传与分子医学研究所，图卢兹大学生物学中心，蒙彼利埃人类遗传学研究所，巴布拉罕研究所剑桥，Forida(美国)的佛罗里达州立大学，巴塞尔的Friedrich Miescher生物医学研究所，那不勒斯大学，柏林卫生研究所，巴塞罗那IRB生物医学研究所，柏林Max Delbruck分子医学研究中心，慕尼黑的表观遗传学和干细胞研究所Helmholtz Zentrum Muenchen以及巴塞罗那基因组调控中心(CRG)的国家基因组(CNAG-CRG)希望确保信息的正确表征，验证和共享，并有效地使用资源。