今天许多药物都是以粉状固体形式生产的。但是为了充分了解活性成分在体内的表现,科学家需要知道它们的确切原子级结构。例如,分子在晶体内排列的方式直接影响化合物的性质,例如其溶解度。因此,研究人员正在努力开发能够轻松识别微晶粉末精确晶体结构的技术。
一支由EPFL科学家组成的团队现在编写了一个机器学习程序,可以在创纪录的时间内预测原子如何响应所施加的磁场。这可以与核磁共振(NMR)光谱相结合,以确定复杂有机化合物中原子的确切位置。这对制药公司来说是一个巨大的好处,制药公司必须仔细监测其分子的结构,以满足患者安全的要求。他们的研究成果发表在Nature Communications上。
人工智能的突破速度
NMR光谱是一种众所周知且高效的方法,用于探测原子之间的磁场并确定相邻原子如何相互作用。然而,通过NMR光谱确定全晶体结构需要极其复杂,耗时的计算涉及量子化学 - 对于具有非常复杂结构的分子几乎不可能。
但是EPFL开发的程序可以克服这些障碍。科学家们从结构数据库中获取了分子结构的AI模型。EPFL工程学院计算科学与建 - 该研究的作者。“为了预测具有近1,600个原子的晶体的NMR特征,我们的技术 - ShiftML - 需要大约6分钟;同样的壮举将需要16年的传统技术。”
这个新计划将使用完全不同的方法成为可能,这些方法将更快并允许更大的分子。“这真是令人兴奋,因为计算时间的大幅加速将使我们能够覆盖更大的构象空间,并正确地确定以前不可能的结构。这使得大多数复杂的当代药物分子都可以实现,”Lyndon Emsley说, EPFL基础科学学院磁共振实验室主任,该研究的共同作者。
该程序现在可以在线免费获取。“任何人都可以在几分钟内上传分子并获得其核磁共振特征,”Ceriotti说。