大家一起来学习下Trimmomatic的具体用法。

自从1983年卡内基研究所的Barbara McClintock因发现跳跃基因而获得诺贝尔奖以来，我们已经了解到我们几乎有一半的DNA由跳跃基因组成 - 称为转座子。鉴于它们能够在发育精子和卵细胞的基因组中跳跃，它们的入侵会引发DNA损伤和突变。这经常导致动物不育甚至死亡，威胁物种的生存。丰富的跳跃基因意味着生物体已经存活了数百万甚至数十亿的转座子入侵。然而，人们对这种适应性的来源知之甚少。现在，一组卡内基研究人员发现，在跳跃基因入侵时，生殖干细胞会促进非编码RNA元件(piRNA)的产生，从而

研究小组发现，生殖干细胞利用新的适应性反应通过激活所谓的DNA损伤检查点来快速驯服入侵的基因元素。这是细胞周期的暂停，允许DNA修复。这些图像描绘了在跳跃基因入侵，DNA损伤检查点暂停以及第四天之后发生的修复过程后，卵巢形态随时间的变化。自从1983年卡内基研究所的Barbara McClintock因发现跳跃基因而获得诺贝尔奖以来，我们已经了解到我们几乎有一半的DNA由跳跃基因组成 - 称为转座子。鉴于它们能够在发育精子和卵细胞的基因组中跳跃，它们的入侵会引发DNA损伤和突变。这经常导致动物不

斯托尔斯医学研究所的研究人员打开了另一个进化生物学的窗口。他们发现，Hox基因是双侧对称动物体形成方式的关键调节因子，也起着控制小明星海葵Nematostella vectensis径向对称体型的作用。这些发现发表在2018年9月28日的“科学”杂志上，使研究人员更好地了解这些基因的祖先功能，并掌握进化生物学中的重要一步。“海葵为我们提供了一个了解Hox基因功能可能的古老过去的窗口，”领导这项研究的Stowers Investigator Matt

两条消息的“邂逅”，为何让基因领军企业均陷入舆论漩涡。

就像世界地图不仅仅是一个地方和街道名称列表一样，基因组不仅仅是一串字母。蛋白质和核酸的复杂编排在DNA中随时间差异地相互作用，因此细胞可以在发育和细胞分化期间或响应于生理和环境方面选择性地管理遗传信息。世界各地的科学家正在开发新技术并在理解核的三维组织动力学方面取得进展。这种新方法将使研究人员能够绘制细胞类型之间的差异，探索基因表达如何在健康或疾病中发挥作用，并发现DNA功能是如何实现的，即使它被包裹在微小核内。“我们知道基因组折叠及其动力学调节基因表达，新技术使我们能够建立3D模型

James Dimond浮潜在伯利兹收集珊瑚。他收集了来自不同环境和一系列分支厚度的27个珊瑚样本。在Netflix上发布的纪录片“追逐珊瑚”，是关于珊瑚礁漂白如何预示这些海洋动物如何应对气候变化的电影警告。珊瑚是海洋健康的关键，因为它们支持最密集，最多样化的生态系统 - 包括从海龟到藻类到礁鱼的物种。华盛顿大学的科学家正在研究新兴的珊瑚遗传学领域，以便更好地预测，甚至可能为珊瑚未来的威胁做好准备。他们的新研究使用现代基因测序工具来揭示三种相似的珊瑚的相关性。&ldquo

当得知姐姐温妮把珍妮的科学比作父亲的高尔夫球时，董建华表示怀疑。他打得那么多，是因为他觉得这是“一个巨大的、肥胖的、多毛的挑战”，温尼说，并建议珍妮也被他们的困难所吸引。珍妮东抗议。然而，她并不否认她的研究解决了一个大而棘手的问题:为什么艰难的社交生活伴随着健康状况的恶化，甚至死亡的风险更大?36岁的董女士将杜克大学的进化人类学和基因组学结合起来，回答了这个“为什么”的问题。长期以来，社会学家一直观察到，社会地位高的人往往比社会底层的人寿命长&md

大多数人都熟悉遗传学，这是一个研究领域，专注于形成梯状DNA结构的精确化学物质序列。然而，表观遗传学并不为公众所熟知。这是研究如何将信息添加到或影响基因读出的研究，Feinberg说，这种研究与遗传学研究相结合并不足以理解人类疾病。费恩伯格是约翰霍普金斯大学基础生物医学科学研究所的表观遗传学中心的负责人，他表示，表观遗传学领域可以捕捉环境暴露后我们的基因组所发生的变化，而DNA测序本身则不然。“我们倾向于认为我们的基因组是静态的，但事实并非如此。大多数疾病受到环境变化的一些组成部分以

这些新结果来自于小规模的实验室研究。研究人员使用基因工程工具对冈比亚按蚊(Ah-NOF-eh-lees gambeae -aye)进行了改变。结果，蚊子在8到12代之间就停止了繁殖。研究人员于9月24日在《自然生物技术》杂志上发表了报告。如果这一发现在更大范围的研究中得到证实，这一工具可能是第一种能够消灭携带疾病的蚊子的工具。“这是伟大的一天，”詹姆斯·布尔说。他是德克萨斯大学奥斯汀分校的进化生物学家。他没有参与这项研究。“我们现在使用的技术可能

海洋基因组学部门确定条纹鲶鱼由于失去其基因组中的EEVS和MT-Ox基因而丧失了制造脊椎动物防晒化合物(a)的能力(b)。这些结果复制了日本河豚和西非Coalacanth的发现，后者也缺乏生产gadusol的能力。条纹鲶鱼Pangasianodon hypophthalmus位于传说中的湄公河，是东南亚最长的河流，也是世界上最大的内陆渔业。越南是该物种的主要生产国，在一年内培育了约110万吨鱼。但与其他商业鱼类不同，例如大西洋鳕鱼或斑点鲶鱼，很少有基因组数据来指导条纹鲶鱼养殖。现在，冲绳科学技术

让细菌变得危险的DNA片段可以被用来杀死细菌。一段被称为致病性岛的DNA可以在菌株之间跳跃，引入新的产生毒素的基因，这通常会使菌株更加有害。科学家们现在已经通过用小鼠体内的致病性金黄色葡萄球菌致残或死亡的基因来取代产生毒素的基因，从而改变了致病性岛屿。研究人员9月24日在《自然生物技术》杂志上发表报告说，如果这种方法对人类有效，它可能会提供一种传统抗生素的替代品，有朝一日可以用于对抗致命的耐药葡萄球菌菌株。致病性孤岛已经为这种内部工作做好了准备:DNA的延伸自然地捆绑成小包裹，很容易进入细菌，传

Wellcome Sanger研究所的科学家及其合作者首次阅读了25种英国物种的基因组。今天(10月4日)在桑格研究所成立25周年之际宣布的25个已完成的基因组序列将导致未来的研究，以了解英国的生物多样性，并帮助保护和理解我们的物种。新测序的基因组将能够研究为什么一些褐鳟迁移到开阔的海洋，而另一些则没有，或研究知更鸟眼中的磁感受器，让他们“看到”地球的磁场。基因组还可以帮助揭示为什么红松鼠容易受到松鼠痘病毒的攻击，但灰松鼠可以携带并传播病毒而不会生病。桑格研究所由Sir

Stenopsyche成人。日本科学家已经阐明了Stenopsyche caddisflies的进化生物学和分布，也称为莎草蝇，日本河流中的常见昆虫和当地美食。这一新发现还发现了先前认可的物种中的新遗传谱系。他们的研究结果于7月18日在淡水科学在线发表。Caddisflies是一群具有水生幼虫阶段的昆虫，而成虫则是陆地，翅膀，蛾类昆虫。在可追溯到三叠纪时期的岩石中发现了僵化的caddisfly幼虫，超过2.5亿年前，当时人们认为该群体已演变成具有完全水生幼虫的群体。目前，全世界已有大约14,50

M13球体模板尖刺金纳米珠的电子显微镜图像与相应的图解说明。该竞赛正在寻找能够精确地安排分子和纳米尺度物体的制造技术。加利福尼亚大学里弗赛德分校的工程师改变了一种病毒，将金原子排列成直径几纳米的球状体。这一发现可以使一些电子元件的生产更便宜，更容易，更快捷。“自然界几千年来一直在组装复杂，高度组织化的纳米结构，其精确性和特异性远远超过最先进的技术方法，”URA Marlin and Rosemary Bourns工程学院电气和计算机工程教授Elaine Haberer说道

如果一个人对转基因食品的安全性持怀疑态度，那么他们也很可能对纳米技术持谨慎态度。密苏里大学的研究人员发现，个人对转基因生物的看法可能会影响他们对纳米技术产品是否应该在商店贴上标签的判断。转基因生物是经过基因改造以改变其特征以获得特定结果的食物和生物。例如，可以改变番茄以增加其对害虫的抗性。纳米技术涉及在纳米尺度上操纵材料的原子和分子以改善其功能，例如使T恤的纤维更耐阳光，或改变高尔夫球杆的表面以帮助它更难击球。“大多数人没有时间和资源来跟上每一项科学进步，因此他们可能依靠过去的经验或

没有批准的药物来治疗可卡因成瘾或过量服用。频繁使用者往往对药物变得越来越不敏感，导致更强或更频繁的剂量。典型的结果是成瘾。即使经过长时间的弃权，接触药物或药物相关线索往往会导致复发。在2018年9月17日出版的“自然生物医学工程”杂志上，芝麻大学研究小组由麻风与重症护理教授Ming Xu博士和Ben May癌症研究部助理教授Xiaoyang Wu博士领导一种新颖的方法，能够扼杀对可卡因的渴望并防止过量服用 - 当在老鼠身上进行测试时。Xu表示，研究人员拥有治疗过量和预防成

噬菌体T7NLC是一种可以在水中发现大肠杆菌的病毒。噬菌体可以与大肠杆菌结合，并将其自身的DNA射入细菌中。然后溶解裂解细菌，释放破坏它的酶，以及发送额外的噬菌体攻击其他大肠杆菌。为了快速检测饮用水中大肠杆菌的存在，康奈尔大学食品科学家现在可以使用噬菌体 - 一种基因工程病毒 - 用于世界各地难以到达的地区。根据英国皇家化学学会于2018年8月发表的最新研究，这项新测试可以在当地进行，以便在数小时内获得答案，而不是将水样送到实验室并等待结果。“受大肠杆菌污染的饮用水是一个主要的公共卫

通过表达细菌基因，白色玫瑰花瓣可呈现蓝色色调。几个世纪以来，园丁们一直试图繁殖蓝玫瑰，但没有成功。但现在，由于现代生物技术，难以捉摸的蓝玫瑰可能最终可以实现。研究人员已经找到了一种方法，可以从白玫瑰花瓣中的细菌表达色素生成酶，将花朵染成蓝色。他们在ACS合成生物学报告他们的结果。虽然自然界中不存在蓝玫瑰，但花店可以通过将玫瑰切成染料来生产蓝色花朵。此外，经过20年的艰苦努力，生物技术专家通过基因工程和选择性育种的结合制造了“蓝玫瑰”。然而，玫瑰比蓝色更加紫红色。Yihua

这些是持有蟒蛇的研究人员。佛罗里达州已成为美国入侵物种的避风港，但也许最着名的国家外来居民是缅甸蟒蛇。这些原产于东南亚的巨型蛇在过去的几十年里已经成熟，甚至在新的环境中蓬勃发展。“在缅甸蟒蛇中，我们观察到佛罗里达州入侵种群的迅速建立和扩张，这在生态上与东南亚非常不同，并且可能对侵入性缅甸蟒蛇种群进行重要的生态选择，”大学生物学教授Todd Castoe说。德克萨斯州阿灵顿分校和Castoe实验室主任。“这种情况具有可以快速适应的系统的所有特征，因此我们很高兴使