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产品信息：
产品描述
细胞在发生凋亡时，会激活一些DNA内切酶，这些内切酶会切断核小体间的基因组DNA。细胞凋亡时抽提DNA进行电泳检测，可以发现180-200bp的DNA ladder。
TUNEL (TdT mediated dUTP Nick End Labeling) 细胞凋亡检测试剂盒（Alexa Fluor 647）可以用来检测组织细胞在凋亡晚期过程中细胞核DNA的断裂情况。其原理是在末端脱氧核糖核苷酸转移酶（Terminal Deoxynucleotidyl Transferase, TdT）的作用下，在基因组DNA断裂时暴露出的3′-羟基（3′-OH）末端掺入Alexa Fluor 647-12-dUTP，从而可以用荧光显微镜或流式细胞仪检测。Alexa Fluor 647为红色荧光染料，具有很高的稳定性和很强的亮度。
本试剂盒应用范围广，可以用于检测冷冻或石蜡切片中的细胞凋亡情况，也可以检测培养的贴壁细胞或悬浮细胞的凋亡情况。
产品组分
运输与保存方法
冰袋（wet ice）运输。
本试剂盒储存在-20℃，Alexa Fluor 647-12-dUTP Labeling Mix避光储存于-20℃，保质期为一年。
注意事项：
1) 需自备用于洗涤细胞的PBS，用于封片的抗荧光淬灭封片液，用于固定的4%多聚甲醛。
2) 为了您的安全和健康，请穿实验服并戴一次性手套操作。
操作步骤
一、样品准备
A． 石蜡包埋组织切片
1. 室温下将石蜡组织切片放入二甲***中浸泡5min，重复一次，以彻底脱掉石蜡。
2. 室温下用100%乙醇浸泡切片5min，重复一次。
3. 室温下用梯度乙醇（90、80、70%）各浸洗1次，每次3min。
4. 用PBS轻轻润洗切片，并用滤纸小心吸干玻片上样本周围多余的液体。这时，可用石蜡笔或疏水笔在样品周围描绘样品分布的轮廓，便于下游透性处理和平衡标记操作。在实验过程中，切勿让样品干燥，处理好的样本放在湿盒中保持样本的湿润。
5. 按1:100的比例，用PBS作为稀释液来稀释2mg/ml的Proteinase K溶液，使其终浓度为20μg/ml。
6. 每个样本上滴加100μl浓度为20μg/ml的Proteinase K溶液，使其被全部覆盖，室温孵育20min。注意：Proteinase K帮助组织和细胞对后续步骤的染色试剂通透。孵育时间过长会增加组织切片在后续洗涤步骤中从载波片上脱落的风险，过短则可能造成透性处理不充分，影响标记效率。未得到更好的结果，可能需要优化Proteinase K孵育的时间。
7. 用PBS溶液润洗样本，轻轻去掉多余液体，并用滤纸小心吸干载玻片上样本周围的液体。处理后的样本放在湿盒中保存样本的湿润。
B． 组织冰冻切片
1. 将玻片浸没在4%多聚甲醛溶液（溶于PBS）中固定，室温下孵育15min。
2. 轻轻去掉多余液体，并用滤纸小心吸干玻片上样本周围多余的液体。
3. 将玻片浸没在PBS溶液中，室温孵育15min。
4. 轻轻去掉多余液体，并用滤纸小心吸干玻片上样本周围多余的液体。这时，可用石蜡笔或疏水笔在样品周围描绘样品分布的轮廓，便于下游透性处理和平衡标记操作。在实验过程中，切勿让样品干燥，处理好的样本放在湿盒中保持样本的湿润。
5. 按1:100的比例，用PBS作为稀释液来稀释2mg/ml的Proteinase K溶液，使其终浓度为20μg/ml.
6. 每个样本上滴加100μl浓度为20μg/ml的Proteinase K溶液，使其被全部覆盖，室温孵育10min。注意：Proteinase K帮助组织和细胞对后续步骤的染色试剂通透。孵育时间过长会增加组织切片在后续洗涤步骤中从载波片上脱落的风险，过短则可能造成透性处理不充分，影响标记效率。未得到更好的结果，可能需要优化Proteinase K孵育的时间。
7. 用PBS溶液润洗样本2-3次。
8. 轻轻去掉多余液体，并用滤纸小心吸干载玻片上样本周围的液体。处理后的样本放在湿盒中保存样本的湿润。
C． 细胞爬片的准备
在Lab-Tek载波片小室（Chamber Slides）上培养贴壁细胞。在凋亡诱导处理之后，用PBS洗2遍载玻片。
D． 细胞涂片的制备（以多聚赖氨酸包被的载玻片为例）
1. 以约2×107个细胞/ml的浓度将细胞重悬于PBS中，吸取50-100μl细胞悬液滴于多聚赖氨酸包被的载玻片上，用一片干净的载玻片轻柔的涂开细胞悬液。
2. 固定细胞，将载玻片浸入装有4%新鲜配制于PBS中的多聚甲醛的染色缸中，在4℃放置25min。
3. 洗涤载玻片，将其浸入PBS中，室温放置5min。重复用PBS洗一次。
4. 轻轻去掉多余液体，并用滤纸小心吸干玻片上样本周围多余的液体。这时，可用石蜡笔或疏水笔在样品周围描绘样品分布的轮廓，便于下游透性处理和平衡标记操作。在实验过程中，切勿让样品干燥，处理好的样本放在湿盒中保持样本的湿润。
5. 按1:100的比例，用PBS作为稀释液来稀释2mg/ml的Proteinase K溶液，使其终浓度为20μg/ml。
6. 每个样本上滴加100μl浓度为20μg/ml的Proteinase K溶液，使其被全部覆盖，室温孵育5min（也可浸于0.2%配制于PBS中的Triton X-100溶液中，室温孵育5min进行通透处理）。注意：Proteinase K帮助组织和细胞对后续步骤的染色试剂通透。孵育时间过长会增加组织切片在后续洗涤步骤中从载波片上脱落的风险，过短则可能造成透性处理不充分，影响标记效率。未得到更好的结果，可能需要优化Proteinase K孵育的时间。
7. 用PBS溶液润洗样本2-3次。
8. 轻轻去掉多余液体，并用滤纸小心吸干载玻片上样本周围的液体。处理后的样本放在湿盒中保存样本的湿润。
二、DNA酶处理阳性对照的步骤
在样本通透处理后，用DNA酶I处理细胞来准备阳性对照载玻片。该流程通常会引起被处理的大多数细胞显现绿色荧光。
注意：DNA酶I处理固定的细胞会引起染色体DNA的断裂，产生许多可标记的DNA 3’-末端。
1. 加入100μl DNA酶I缓冲液到固定的细胞中，室温孵育5min。
2. 轻叩掉液体，加入100μl含5.5-10 units/ml DNA酶I的缓冲液，室温孵育10min。
3. 轻叩载玻片去掉多余的液体，并将载玻片在装有去离子水的染色缸中彻底洗3-4次，该染色缸是专门用于阳性对照的。注意：阳性对照载玻片必须使用单独的染色缸，否则，来自阳性对照载玻片上残余的DNA酶I活性可能会在实验载玻片上引入高的背景。
三、标记与检测
1. 按1:5的比例用去离子水稀释5×Equilibration Buffer。
2. 每个样本滴加100μl 1×Equilibration Buffer使其全部覆盖待检样本区域，室温孵育10-30分钟。或者将载玻片放入一个含有 1×Equilibration Buffer的缸中，保证缓冲液没过样本。在平衡细胞的同时在冰上解冻Alexa Fluor 647-12-dUTP Labeling Mix，并且依照表1，准备足够量的用于所有实验的和可选阳性对照反应的TdT孵育缓冲液。对于面积小于5cm2的一个标准反应，其体积是50μl，用50μl乘以实验和阳性对照反应的数目来确定所需TdT孵育缓冲液的总体积。对于表面积更大的样本，可成比例的增大试剂体积。 表1.准备用于实验的和可选阳性对照反应的TdT孵育缓冲液 阴性对照体系：准备一份不含TdT酶的对照孵育缓冲液，用ddH2O替代TdT酶。 3. 在平衡后的区域周围用吸水纸洗掉100μl 1×Equilibration Buffer中的大部分，然后在5cm2面积的细胞上加入50μlTdT孵育缓冲液。不要让细胞干掉。这之后的操作，载玻片要避光。 4. 把塑料盖玻片盖在细胞上以保证试剂的平均分布，在湿盒的底部放上用水浸湿的纸巾。将载玻片置于湿盒内，在37℃孵育60min。将湿盒用铝箔纸包裹以避光。 注意：塑料盖玻片在使用前可以切成两半。折起盖玻片的边缘以便于移除和操作。 5. 移除塑料盖玻片，并将切片置于PBS溶液中室温孵育5min，重复2次。 6. 用滤纸轻轻擦掉样本周围及背面的PBS溶液。注意：为了降低背景，载玻片在用PBS洗一遍后，可再用含0.1%Triton X-100和5mg/ml BSA的PBS洗3次，每次5min，这样游离的未反应的标记物可以清楚较干净。 7. 样本在染色缸中染色，在黑暗中将载玻片浸入装有DAPI溶液的染色缸，室温放置5分钟。DAPI溶液用PBS新鲜配制并稀释到2 μg/ml。 8. 洗涤样本，将载玻片浸入去离子水中，室温放置5分钟。重复两次，总共洗三次。 9. 叩干载玻片上多余的水并且用吸水纸擦拭细胞周边的区域。 10. 立即在荧光显微镜下分析样本，在651 nm下检测Alexa Fluor 647红色荧光，在460 nm观察蓝色的DAPI。DAPI能将凋亡和未凋亡的细胞都染成蓝色，只在凋亡的细胞核中才有Alexa Fluor 647-12-dUTP掺入而定位的红色荧光。如有必要，载玻片能在4℃黑暗条件下存放过夜。 四、利用流式细胞术检测悬浮细胞 1. 将3-5×106个细胞用PBS在4℃离心（300×g）洗两次，然后重悬在0.5ml PBS中。 2. 固定细胞，加入5ml 1%配制于PBS中的多聚甲醛溶液，冰上放置20min。 3. 细胞在4℃300×g离心10min，去上清并且重悬于5ml PBS。重复洗一次，并用0.5 ml PBS重悬细胞。 4. 通透细胞，加入5ml冰上预冷的70%乙醇，在-20℃孵育4小时。细胞能在70%乙醇中-20℃条件下保存一周，或者，细胞可用配制于PBS中的0.2% Triton X-100溶液通透，室温放置5min。 5. 细胞在300×g离心10min，并用5 ml PBS重悬。重复离心，并1ml PBS重悬。 6. 转移2×106个细胞至一个1.5ml的微量离心管。 7. 300×g离心10min，去上清，并用80μl 1×Equilibration Buffer重悬。室温孵育5min。 8. 在平衡细胞的同时，在冰上融解Alexa Fluor 647-12-dUTP Labeling Mix，并且依照表1，准备足够量的用于所有反应的TdT孵育缓冲液。对于2×106个细胞的一个标准反应，其体积是50μl，用50μl乘上反应数目来确定所需TdT孵育缓冲液的总体积。 9. 细胞在300×g离心10min，去上清并把沉淀重悬在50μl TdT孵育缓冲液中，37℃孵育60min，避光。每隔15min用微量移液器轻轻重悬细胞。 10. 加入1ml 20mM EDTA终止反应，用微量移液器轻柔混匀。 11. 300×g离心10min，去上清并把沉淀重悬在1ml配制于PBS中的0.1% Triton X-100溶液，其中含5mg/ml BSA，重复一次，总共洗2次。 12. 用流式细胞仪分析细胞，测量651 nm的Alexa Fluor 647红色荧光。
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