革兰氏阳性菌质粒大量提取试剂盒
产品内容:
溶菌酶 | 10ml |
RNaseA(10mg/ml) | 1ml |
溶液Ⅰ | 60ml |
溶液Ⅱ | 60ml |
溶液Ⅲ | 80ml |
漂洗液 | 15ml×2 |
洗脱液 | 30ml |
吸附柱 | 10个 |
收集管(50ml) | 10个 |
说明书 | 1份 |
使用前请先在漂洗液中加入无水乙醇,加入体积请参照瓶体上的标签。溶液Ⅰ在使用前先加入 RNaseA(将试剂盒中提供的 RNaseA 全部加入) ,混匀,置于 2-8℃保存。如非指明,所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。
操作步骤:
1、取 50-200ml 细菌培养物,11000rpm 离心 5min,尽量吸除上清(菌液较多时可以通过多次离心将菌体沉淀收集到一个离心管中)。
2、向留有菌体沉淀的离心管中加入 5ml 溶液Ⅰ和 1ml 溶菌酶,混匀。37℃水浴 30 min 以上(根据菌液量可适当加长水浴时间,请先检查溶液Ⅰ是否已加入 RNaseA),使用移液器或旋涡振荡器彻底悬浮细菌细胞沉淀。
注意:如果菌块未彻底混匀,会影响裂解导致质粒提取量和纯度偏低。
3、向离心管中加入 5ml 溶液Ⅱ,温和地上下翻转 6-8 次使菌体充分裂解。注意:混匀一定要温和以免污染基因组 DNA,此时菌液应变得清亮粘稠,作用时间不要超过 5 min,以免质粒受到破坏。
4、向离心管中加入 7ml 溶液Ⅲ,立即温和地上下翻转 6-8 次, 充分混匀,此时会出现白色絮状沉淀。 11000rpm离心 10 min ,用移液器小心地将上清转移到另一个干净的离心管中,尽量不要吸出沉淀。注意:溶液Ⅲ加入后应立即混匀,避免产生局部沉淀。如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清。
5、将上一步所得上清液加入吸附柱中(吸附柱加入收集管中),室温放置 2min,11000rpm 离心 2min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中( 如果一次加不完,可分两次吸附) 。
6、向吸附柱中加入 8ml 漂洗液( 使用前请先检查是否已加入无水乙醇) ,11000rpm离心 2min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
7、向吸附柱中加入 6ml 漂洗液,11000rpm离心 2min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
8、11000rpm 离心 5min,将吸附柱敞口置于室温或 50℃温箱放置数分钟,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,否则漂洗液中的乙醇会影响后续实验如酶切、PCR 等。
9、将吸附柱放入一个干净的离心管中,向吸附膜中央悬空滴加 1-2ml 经 65℃水浴预热的洗脱液,室温放置5min,11000rpm离心 2min,收集质粒DNA溶液。
10、(可选)为了增加质粒的回收率,可将得到的洗脱液重新加入吸附柱中,室温放置 5min, 11000rpm离心 2min。
注意事项:
1、使用前请先检查溶液Ⅱ和溶液Ⅲ是否出现混浊,如有混浊现象,可在 37℃水浴中加热几分钟,待溶液恢复
澄清后再使用。
2、洗脱缓冲液体积不应少于 500ul,体积过小影响回收效率;洗脱液的 pH 值对洗脱效率也有影响,若需要用水做洗脱液应保证其 pH 值在 8.0 左右( 可用 NaOH 将水的 pH 值调至此范围) ,pH 值低于 7.0 会降低洗脱效率。DNA产物应保存在-20 ℃,以防 DNA降解。
3、如果所提质粒为低拷贝质粒或大于 10kb 的大质粒,应加大菌体使用量,使用 400-800ml 过夜培养物,同时比例增加溶液Ⅰ、溶液Ⅱ和溶液Ⅲ的用量,吸附和洗脱时可以适当的延长时间,以增加提取效率。
4、 DNA浓度及纯度检测:得到的质粒DNA纯度与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。得到的DNA可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。DNA应在OD260处有显著吸收峰, OD260 值为 1 相当于大约 50 μg/ml 双链DNA、40 μg/ml 单链DNA。OD260/OD280比值应为 1.7-1.9 ,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用去离子水,比值会偏低,因为pH值和离子存在会影响光吸收值,但并不表示纯度低。
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