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Sequencher 是 DNA 序列分析的工业标准软件。它可以和所有的自动序列分析仪一同工作，并且因为它的极速 Contig组装、很短的学习曲线、用户友好的编辑工具，以及卓越的技术支持而众所周知。从差不多 15 年前释出第一个版本到现在，Sequencher在每个基因专业和制药公司中都应用与于序列分析任务，同时在全球超过40个国家里为数众多的学术和政府实验室中使用。Sequencher被生命科学研究者们使用于许多不同的 DNA 序列分析应用方面，包括基因重组、突变检测、法医的人体辨别，以及分类学等等... Sequencher能力包括杂合子和 SNP 的检测和分析，cDNA 到 染色体 DNA 的大型间隙对准，比较排序，对置信评分的支持、ORF转换、基因银行特性化导入、以及限制酶映射等等。 
Sequencher 产品特性： SNP 检测 (SNP Detection) 序列装配 (Sequence Assembly) 序列编辑 (Sequence Editing) 自动分析 (Automated Analysis) 矢量微调 (Vector Trimming) SNP 检测使用 Sequencher 来进行比较对准以便鉴别和报告 SNP 以及突变。 序列装配 Sequencher 的装配算法可以将你的 DNA 片断快速而又准确的装配起来。自觉的工具允许你在数秒内就可以设置好参数并且调整它们。 序列编辑 Sequencher能够给你足够的信心认为一个序列是绝对正确的。你可以只观察一个序列的色谱图，你也可以从前端或反方向同时查看多个对齐的色谱图。在你的已对齐数据中滚动是很容易的。你可以使用Sequencher 的选择工具来高亮不一致或者低质量的区域。 自动分析 Sequencher 可对你的数据进行批处理，这个过程是透明、用户可定义、可恢复的，并且 Sequencher 从不为了自动化的目的而破坏你科学结论的正确性。 矢量调整 自动排序器以基础调用错误生成结果。从 DNA 库克隆的序列通常包括矢量序列、polyA尾，或其他不相关序列。内含子和引物序列通常会和放大的外显子序列侧面相连。不调整的话，这些污染物会扭曲你的装配和下游分析。 Sequencher允许你调整低质量或者含糊的数据。“Trim Ends”将令人误解的数据从序列片段的尾部去除。“TrimVector”将污染序列尾部的特定序列数据移除。“Trim to Reference”剔除超出装配参考序列的序列尾部。
