细菌16S rDNA菌种鉴定

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更新: 2024-11-05
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细菌16S rDNA菌种鉴定

 

16S rDNA是编码原核生物核糖体小亚基Rrna(16S rRNA)DNA序列,存在于所有细菌染色体基因组中。16S rDNA分子大小适中,突变率小,是细菌系统分类学研究中最常用,最有用的“分子钟”。其序列包含9个可变区(variable region)和10个恒定区(constant region)。保守序列区域反映了生物物种间的新缘关系,而高变序列区域则能体现物种间的差异。16S rDNA的序列特征为不同分类级别的近缘种系统分类奠定了分子生物学基础。

 

近几年来,国内外学者采用不同的分子生物学方法对各种细菌的16S rDNA进行了广泛的研究,获得了大量的16S rDNA序列信息,瓶集中于NCBI数据库中。将测序得到的16S rDNA序列在NCBI上进行Blas比对,即可获知与该序列同源性较高的已知序列,为确定菌种的分类学地位提供依据。

 

 

 

送样要求

 

 

1. 若提供平板,甘油菌或穿刺菌,请注明培养条件,菌种培养需特殊培养基的请提供培养基;请确保您提供的平板或斜面上的单菌落经过至少三次的分离纯化。因实验样品不纯造成的测序套峰,我们将收取全额的实验费用。

 

2. 若提供基因组DNA样品,请确保基浓度 10ng/ul,总体积50ul.样品定量检测结果将以我们为准。

 

3. 若提供的菌株为革兰氏阳性菌,建议您提供基因组DNA

 

4. 我们不接受具有致病性的样品。如果您的菌株带有致病性,请提供菌株的基因组DNA,并对其进行处理以灭活致病菌。

 

实验周期

 

实验周期为1-2周,实际完成时间视具体样品量而定。

 

提供结果

 

1. 结题报告,包括实验流程,PCR产物电泳图,进化树结果等

 

2. 测序峰图文件

 

3. 序列文件