AccuPower® qPCR Array基因表达分析系统

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更新: 2021-05-24
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提供商: Bioneer Corporation
服务名称: 基因表达分析系统
AccuPower® qPCR Array基因表达分析系统
 
qPCR Array系统介绍
qPCR Array系统将最灵敏和可信的基因表达分析方法-Real-time PCR和微阵列芯片的优点综合起来,可同时分析多基因表达情况。是一个全新的结果准确而成本较低的分析系统。该系统以多孔板(96/384)的形式同时筛查不同通路的基因或者特定疾病相关的基因,使得用户可同时查看多个基因的表达模式。所获得的结果符合MIQE指南要求,因此结果几乎无需改变可直接在SCI期刊上发表。
 
qPCR Array的应用
qPCR Array系统使用的是Bioneer已验证的AccuTarget™ qPCR Primerlibrary。根据不同的研究目的,按照不同通路的或特定的疾病,进行微阵列组合,从而可以广泛用于各种研究。它可以用于癌症,免疫学,干细胞,毒性试验,分子靶标挖掘与鉴定,细胞遗传分析和转基因动物研究等领域。Bioneer的qPCR Array系统分为十个应用研究领域:
* Cancer Research
* Cellular Differentiation & Regulation
* Disease Research
* Immunology Research
* Metabolism Research
* Signal Transduction
* Stem Cell & Cell Development
* Toxicology & Drug metabolism
* Biological Process
* Unknown Genes
 
qPCR Array系统优势
操作简便
无需自己设计引物,摸索实验条件。使用qPCRArray系统可以轻松地完成对基因表达图谱的检测。所有检测使用的引物,均通过Bioneer严格的验证,确保检测的准确性和灵敏度,引物的特异性,可重复的实验结果。qPCR Array实验板经过优化,所有基因均使用同一扩增条件。
 
高通量检测
使用qPCR Array系统可以轻松同时对多基因表达图谱进行分析,检测板以96孔或384孔板形式提供。
 
可灵活选择
根据客户感兴趣的的信号通路或疾病模型检测相应的基因表达图谱,也可定制文库。
 
qPCR Array实验流程


qPCR Array
实验设计示例
 
表一:Human Cancer panel qPCR Array
每个孔可以检测Cancer panel中对应的基因,一次可以检测84个基因,H1-H12为对照组,HK1-HK5代表的是管家报告基因,GDC为检测是否存在基因组DNA污染,RTC为RT反应对照,PC为PCR扩增效率对照。

 
Bioneer qPCR Array System Performance
高灵敏度

 
图1:微量的RNA模板可有效被检出
AccuPower® RocketScript™ Cycle RT PreMix是Bioneer独有的高温循环逆转录产品,具有高灵敏度、高特异性和产量高等特点。使用该产品对10-1000ng 的 NPY1R RNA为起始模板,合成cDNA,然后进行Neurotrophins and Receptors PCRLibrary灵敏度检测,Ct值小于35为阳性扩增,结果显示低至10ng的总RNA量中,Gene qPCR Array阳性检出率在80%以上。
 
高特异性
Bioneer公司在分子生物学领域有20多年的研究经验,qPCR Array系统中使用的基因检测引物均由资深技术人员,全程遵循MIQE指南进行实验,获得的已验证且优化好的引物,使用这些引物能获得准确,可重复的数据。
AccuPower® qPCR Array基因扩增产物具有如下特征:单峰熔解曲线,单一电泳条带,无引物二聚体,较短的扩增子(100-200bp)。

 
图2. 引物验证结果(CCND3 基因示例)
 
检出范围宽&高PCR效率
高扩增效率:>95% PCR efficiency*
高灵敏度:~10 copies per cell
检出范围宽:101 - 109 copies
 

 
图3.动态范围&PCR效率(AKT基因示例)。qPCR中使用的模板是十倍稀释后的纯化的cDNA。每个稀释点做两个复孔。
 
结果分析
  
 
 
 Bioneer qPCR Array服务案例
 
 
  研究内容 样本 基因明细 (Library)
1 Human Nf-kB target gene 表达率测定 Human cell NF-kB Signaling Pathway
2 由食品成分引起的抗炎症反应效果测定 Mouse cell 定制基因(4基因)
3 Mouse melanocyte中使用美白物质处理时,测定相关基因表达的差异 Mouse cDNA 定制基因(7基因)
4 HeLa CCL2细胞shRNA处理后测定centrosome-related gene的表达差异 Human RNA 定制基因(103基因)
5 确认口腔癌细胞总正常细胞和抗癌耐性细胞之间的基因表达差异 Human cDNA 定制基因(15基因)
6 Oncogene过表达的细胞株通过处理cytokine后, 检测cancer cell的immune escape相关的基因表达差异 Human cDNA 定制基因(15基因)
7 处理特定 microRNA的 mimic后,确认gastric cancer cell中 target gene的表达之后,检测相关基因的signal pathway有无变化 Human cDNA 定制基因(15基因)
8 处理大肠癌细胞株sw480中的phytochemical后,大肠癌的增殖,转移,血管形成相关的特异基因的表达趋势的测定 Human cDNA 定制基因(15基因)
9 分析胰腺癌细胞株 MIA PaCa和Capan的src family kinase gene的 mRNA表达影响, 寻找抗癌效果和基因表达影响的相关关系. Human cDNA 定制基因(6基因)
10 检测褥疮患者治疗前后褥疮组织及体液中基因的表达差异 Human Tissue 定制基因(6基因)

 
 
Bioneer qPCR Array Library list
 



 
 

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