合肥基赛生物供应Fermentas EcoRI ER0271

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单价: 135.00
品牌: Fermentas
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更新: 2021-05-27
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货号: ER0271
供应商: 合肥基赛生物科技有限公司
保存条件: -20度
规格: 5000 units

Product information
5'...G^A A T T C...3'
3'...C T T A A^G...5'

Reaction conditions

 

Recommended buffer for 100% activity
Optimal temperature
Enzyme  activity in Fermentasbuffers, %
Tango buffer for double digestion

B(blue)
1× 
 

G(green)
1× 
O(orange)1× 
R (red)
Tango(yellow)
1×/2× 
EcoRI
37°C
0-20
NR
100
100*
NR
100
2× 
* 星活性比5倍过量酶切(5 units×1 hour)还强。

 

100%酶活性的反应条件

1× 缓冲液EcoRI:
        50 mM Tris-HCl (pH 7.5, 37°C), 10 mM MgCl2, 100 mM NaCl, 0.02% Triton X-100, 0.1 mg/ml BSA。
        37°C酶切。
保存缓冲液

EcoRI保存在:
        10 mM磷酸钾 (pH 7.4, 25°C), 300 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.2 mg/ml BSA, 0.15% Triton X-100和50%(v/v)甘油。
连接和重新酶切

        50倍EcoRI过量酶切后,超过95%的酶切产物可以连接和重新酶切。
琼脂糖包埋DNA酶切

        至少需要5 unit限制酶才能在16小时内完全切割1 µg琼脂糖包埋的λ DNA。
注:低盐、过量酶切、pH>8.0或用Mn2+替代Mg2+都会导致星活性。
兼容性末端

        XapI, MunI, TasI。
甲基化影响

        Dam: 无重叠 – 不影响。
        Dcm: 无重叠 – 不影响。
        CpG: 可能重叠 – 部分影响。
        EcoKI: 无重叠 – 不影响。
        EcoBI: 可能重叠 – 不影响。

 

Methylation type
Sequence
Cleavage effect
CpG
5'...m5C GAATTm5C G...3'
3'... Gm5CTTAA Gm5C...5'
部分影响
EcoBI (TGA(N)8TGCT)
5'...TGm6AATTC(N)4TGCT...3'
3'...ACTTAAG(N)4m6ACGA...5'
不阻止酶切

Cleavage efficiency close to the termini of PCR fragments

 

 

bp from the recognition  site tofragment end
1 2 3 4 5
50-100
Number of recognition sites in DNA molecules

 

 

Lambda ΦX174 M13mp18/19 pBR322 puc18/19 pUC57
5  0 1 1 1 1
pTZ19R/U  pTZ57R pBluescriptIIKS(-/+)  pBluescriptIISK(-/+) pACYC177  pACYC184
1 1 1 1 0 1
Protocols & recommendations
DNA酶切
        我们推荐在20 μl反应体系中,用2-10倍过量的限制酶切割0.2-1.5 μg DNA。标准的限制酶切操作方法如下:

 

1.  按先后顺序添加以下组分:

 

水,无核酸酶 16-16.5 µl
10×缓冲液 2 µl
底物 DNA 1 µl (~1 µg)
限制酶 0.5-1 µl (5-10 u)
总体积 20 µl
2.  轻轻混匀后短暂离心。

 

3.  优化反应温度下孵育1-16小时。

备注

a.  酶切反应体系可相应地放大或缩小。

b.  有些限制酶需要添加剂才能达到所描述的活性。在这种情况下,加入添加剂并相应调整水的体积。

PCR产物酶切
        PCR产物酶切最方便的途径是在PCR完成后直接将限制酶加入到PCR反应管中。Fermentas公司的大多数限制酶在Fermentas公司的PCR缓冲液中有活性。
        然而,在PCR扩增反应液中,PCR产物酶切效率往往不高。因此,酶切时加入的PCR扩增反应液体积不要超过酶切反应总体积的1/3,否则会抑制酶切效率。

1.按先后顺序添加以下组分: PCR 扩增产物 10 µl (~0.1-0.5 µg of DNA)

PCR反应产物 10 µl (~0.1-0.5 µg of DNA)
水,无核酸酶 16-17 µl
10× 缓冲液 2 µl *
限制酶 1-2 µl (10-20 u)
总体积 30 µl
* 在30 μl反应体系中,未纯化PCR产物酶切时只需2 μl 10X 反应缓冲液。

 

2.  轻轻混匀后短暂离心。

3.  优化反应温度下孵育1-16小时。

备注

a.  克隆应用时,酶切前需重新纯化PCR扩增产物,以除去PCR扩增产物中的嗜热性DNA聚合酶。DNA聚合酶可能会改变酶切后DNA的末端,降低连接产量。

b.  如果限制酶需要特殊的添加剂(如SAM),需相应调整水的用量。如果PCR扩增产物切割效率不高,酶切前用DNA Gel Extraction Kit 重新纯化PCR扩增产物。

c.  酶切后,用DNA Gel Extraction Kit 纯化PCR扩增产物以除去短片段DNA。因为连接时短片段DNA会与插入片段竞争克隆载体。

双酶切
        我们的DoubleDigest™ 搜索引擎是一个非常强大的搜索工具,可以找到满足您需求的双酶切最佳缓冲液和反应条件。该引擎操作简单,只需选定双酶切的限制酶,提交查询即可获得双酶切的推荐说明。DoubleDigest™ 搜索引擎随Fermentas公司新开发限制酶的添加而不断更新。

琼脂糖包埋DNA酶切
1.  1%低熔点琼脂糖包埋底物DNA,包埋比例为1 μg DNA/ 30 μl琼脂糖。

2.  采用GelSyringe® 或类似的琼脂糖剂量分配系统制备~30 μl琼脂糖块。

3.  将琼脂糖块浸入约100 μl 1X酶切缓冲液系统15分钟,平衡琼脂糖块内外的缓冲液系统。

4.  将琼脂糖块浸入100μl新鲜的含有限制酶的1X酶切缓冲液中。

5.  嗜温性酶选用37°C孵育;嗜热性酶选用推荐的50°C、55°C或65°C孵育,酶切时间约4-16小时。

温馨提示:不可用于临床治疗。