基于Label Free的定量蛋白组分析

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更新: 2021-05-28
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蛋白质非标记定量技术(label-free)是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
 
实验原理
基于SILAC和iTRAQ的定量蛋白组学研究技术都是首先标记蛋白然后利用质谱进行分析;尽管提供的蛋白定量信息量巨大,但是标记试剂比较昂贵,每一个样品的成本较大,因此比较适合在整个蛋白组水平上对蛋白的表达变化进行定量的分析;对于相对简单的蛋白混合物,比如说co-IP的样品来说,投入产出比比较低;对于某些翻译后修饰方式的蛋白组学研究来说,比如泛素化研究,本身泛素化就是发生在赖氨酸上侧链上,对于泛素化肽段的富集是利用针对赖氨酸侧链上残留的两个甘氨酸(gly-gly)的抗体来实现的,但是iTRAQ试剂的标记会对此富集过程产生很大的影响,因此就不能使用iTRAQ标记技术对组织样品的泛素化修饰进行组学水平上的分析。
Label Free定量分析技术就是基于此实验需求建立起来的定量蛋白组学技术。 同一个肽段在质谱分析过程中离子化效率相同,质谱峰的面积就直接代表了该肽段量的多少,因此可以直接通过比较同一肽段质谱峰面积的方法直接得到该肽段所代表的蛋白的相对定量信息。
 
研究路线


应用领域
疾病标志物筛选、疾病控制机制、药物作用靶点研究、发育机制研究、产量提高、作用机制研究、植物抗逆、营养吸收机制研究、稀有物种研究、特殊功能蛋白质筛选。
 
技术优势
1.无需昂贵的稳定同位素标签标记样本,实验成本低;
2.信息量大,样本数不受限制,可用于大规模数量样本检测;
3.对样本的操作较少,并且不受样品条件的限制,所需样本量低;
4.可以检测到的肽段动态范围可以达到4个数量级以上,提高了低丰度蛋白质的检测效率、非标记定量准确性。
 
样品要求
 
样品类型 送样要求
常规动物组织 15mg
坚硬动物组织 100mg
动物毛发 10mg
常规植物组织 100mg
木本植物的树根、树皮、树枝等 2g
果实种子 0.2g
花粉 100mg
微生物 200mg
动物细胞 1×10^7个细胞
血液 至少1ml(血浆注意用EDTA防凝)
血清、血浆 血清0.2-0.5ml
乳汁 1ml
脑脊液、关节液和淋巴液 0.2ml
唾液 0.05ml
泪液 100μl
尿液 5ml
分泌蛋白 5ml

1. 如果您提供的是co-IP样品,蛋白需求量在2-5ug左右,另外在实验最后一步对蛋白样品进行洗脱的过程中,不要使用去污剂(例如SDS)以及高的氧浓度;或者您可以直接将含有蛋白样品的beads给寄给我们,我们负责后续的实验。 
2. 如果您提供的是组织样品,请您干冰将组织样品寄给我们;
3. 如果您提供的是蛋白样品,请您保证蛋白总量在100ug以上;蛋白提取时使用普通的组织、细胞裂解液即可。 
4. 样品运输:请使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性。
服务周期及报价

周期:4-5周
报价:对于co-IP样品,1600元/样品,优惠价1450元/样品,预订价1,350元/样品,包含生物信息学分析;
其它样品优惠价3299元/样品,如有其它要求,根据您的实验计划提供相应报价。
活动时间:即日起至2017.1.10
活动说明:下单,立即开始试验;预定,年后任意时间可开始

结果展示
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研究案例
我们会根据您的要求提供之前项目的部分数据作为参考