亚细胞器蛋白组学

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更新: 2021-05-29
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随着蛋白质组学研究的不断细化和深入,亚细胞水平的蛋白质组成为当前蛋白组学研究的热点之一。通过多种策略和技术方法,亚细胞蛋白质组学研究可以减少全细胞蛋白组分析的复杂性,到目前为止,几乎所有亚细胞结构的蛋白质组学研究都有报道,而且已经深入到亚细胞器和复合体水平;另外,不仅局限于对亚细胞结构的蛋白组成进行简单分析,而且更注重功能性分析,将定量技术和差异分析引入亚细胞蛋白质组学,来观察亚细胞结构的蛋白质组在某些生理或病理条件下的变化,这已经成为亚细胞蛋白质组学新的发展方向。
我们利用已经建立的成熟的超高分辨率、高灵敏度的液相色谱-质谱联用技术(LC-MS/MS),结合已经发表的文献,实现了对多个亚细胞器组分的定性和定量分析,包括细胞质膜蛋白质组、细胞核蛋白质组、线粒体蛋白质组和突触体蛋白质组等。
 
实验原理
目前来看,亚细胞器蛋白组学研究是将传统的成熟的亚细胞器分离和富集技术与现在建立的超高分辨率、高灵敏度的液相色谱-质谱联用技术(LC-MS/MS)结合,实现对亚细胞器组分的鉴定和定量分析。在此技术路线中,亚细胞器组分蛋白的富集和分离是关键。在实际亚细胞器组分富集和分离过程中,会通过两方面的实验来验证亚细胞器蛋白样品是够符合实验的要求:首先会选择公认的定位于该亚细胞器的蛋白作为富集是否成功的标准,例如在质膜蛋白质组学样品准备过程中,我们会选择Na+/K+-ATPase作为标志物(Marker),通过检测该标志物在样品准备过程中的富集程度作为该亚细胞器组分是否得到有效富集的标准;同时,我们还有选择工人的不定位于该炎细胞器的蛋白作为分离是否成功的标准,例如在质膜蛋白质组学样品准备过程中,我们会通过检测Beta-actin在样品准备过程中是否得到有效去除作为该亚细胞器组分是够得到有效分离的标准。在样品准备过程中,只有在确保亚细胞蛋白组分得到有效富集的同时又能有效的去除杂质蛋白组分,才能进行下一步的质谱分析实验。考虑现在质谱平台已经建立,亚细胞器组分的成功分离是进行亚细胞蛋白组学研究的关键。
 
研究路线



样品要求

在实际亚细胞器组分富集和分离过程中,会通过两方面的实验来验证亚细胞器蛋白样品是够符合实验的要求:首先会选择公认的定位于该亚细胞器的蛋白作为富集是否成功的标准,例如在质膜蛋白质组学样品准备过程中,我们会选择Na+/K+-ATPase作为标志物(Marker),通过检测该标志物在样品准备过程中的富集程度作为该亚细胞器组分是否得到有效富集的标准;同时,我们还有选择工人的不定位于该炎细胞器的蛋白作为分离是否成功的标准,例如在质膜蛋白质组学样品准备过程中,我们会通过检测Beta-actin在样品准备过程中是否得到有效去除作为该亚细胞器组分是够得到有效分离的标准。在样品准备过程中,只有在确保亚细胞蛋白组分得到有效富集的同时又能有效的去除杂质蛋白组分,才能进行下一步的质谱分析实验。

服务周期及报价
服务周期:20-30个工作日
报价:我们会根据您的试验目的提供详细的试验计划,并根据实验计划提供相应的价格信息。

结果展示
项目完成之后,我们会提供完整的技术报告。报告中我们会提供详细的实验步骤、相关的质谱参数和鉴定物质的信息,鉴定和定量得到的蛋白和肽段信息以Excel表格的形式给出,如果您需要质谱原始数据,我们会以DVD光盘的形式寄送给您。