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| 提供商： | 派森诺生物 |
简介：
全基因组重亚硫酸盐测序（whole genome bisulfite Sequencing）是指通过重亚硫酸盐对基因组DNA进行处理，将未甲基化的C碱基转化为U碱基，而甲基化的C则不会改变，进行PCR扩增后U碱基会变成T，与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来，再结合高通量测序技术，可绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。特定物种的高精确度甲基化修饰模式的分析，必将在表观基因组学研究中具有里程碑式的意义，并为细胞分化、组织发育等基础机制研究，以及动植物育种、人类健康与疾病研究奠定基础。
推荐平台：Illumina Hiseq2000
信息分析流程图
二、信息分析
1. 原始数据整理、过滤及质量评估
1.1 去接头及低质量序列过滤
1.2 测序质量评估
2. 甲基化基础信息分析：
2.1 测序序列与参考基因组比对；
2.2 测序深度和覆盖度分析：C碱基测序有效深度分布以及覆盖度统计；
2.3 全基因组胞嘧啶甲基化水平评估：C、CpG、CHG和CHH平均甲基化水平，CpG、CHG和CHH中的所有C碱基的甲基化水平；
3. 甲基化高级信息分析：
3.1 甲基化C碱基中CG、CHG和CHH的分布比例
3.2 各条染色体、不同基因区域和不同基因元件区域中CG、CHG和CHH中C的甲基化水平；
3.3 CHG和CHH中甲基化胞嘧啶附近9 bp的序列特征分析；
3.4 全基因组甲基化图谱：染色体水平的甲基化胞嘧啶密度分布，不同基因组区域和转录元件中的DNA甲基化水平；
3.5 差异性甲基化区域筛选（DMR）；
3.6 差异甲基化位点或区段的CpG岛注释和基因注释。
三、送样要求
1. 样品质量要求：OD 260/280值应在1.8～2.0 之间。电泳检测无明显RNA污染，基因组条带清晰、完整，无降解。
2. 样品浓度要求：浓度≥100ng/ul；总量不低于20 ug。
3. 请仔细填写DNA样品信息表，提供DNA样品编号、数量、浓度、体积、制备时间、溶剂名称及物种来源。并且请同时提供质量检测相关数据和图片，包括分光光度、电泳胶图或Nanodrop仪器检测数据。
4. 样品包装：对DNA样品，我们建议使用1.5ml离心管装载样品，并且用封口膜密封。并请在各样品管上做好清楚的标识，最好写在标签纸上，贴在管壁。
5. 样品运输：DNA样品请用干冰或者冰袋运输。干冰运输时间不要超过72小时；冰袋运输，时间最好不要超过24小时。
四、产品优势
1. 高分辨率和准确度：单碱基精确度，精确分析每一个C碱基的甲基化状态。
2. 高覆盖度：在全基因组水平上最大限度的获取完整的甲基化信息，精确绘制全基因组甲基化图谱。
五、研究领域
1. 基础研究：癌症、发育生物学、干细胞分化
2. 医药：DNA甲基化转移酶抑制剂
3. 临床诊断检测：肿瘤早期检测、肿瘤分类、分级
通过上海市工商行政管理局认证 
