454GS-FLX测序

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更新: 2021-06-02
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服务名称: 454GS-FLX测序
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    市场部邮箱:biokitmarket@163.com
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  • 服务概述
         公司拥有454GS-FLX系统,利用该系统对外开展深度测序服务。454测序系统是一种焦磷酸、微流体技术并行 的测序系统,依赖生物发光技术进行DNA序列分析。在DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和双磷酸酶的协同作用 下,将引物上每一个dNTP聚合与一次荧光信号释放相偶联。通过检测荧光释放的强度,达到实时测定DNA序列的目 的。此技术不需要荧光标记的引物或核酸探针,也毋需扩增产物进行电泳分离。
         该技术样品制备简单,序列数据读取精确度和长度高(400-500碱基),并具有分析结果快速、准确、灵敏度高 和自动化等特点。结合GS-FLX Titanium试剂,双通道运行一个循环10小时,能够产生大约400-600Mb的序列数据。 系统自带的高效分析工具软件可进行全新序列组装,参考序列组装和变异分析。 该系统依靠油包水乳液中小珠上固定的寡核苷酸捕获单链DNA片段进行emPCR扩增。每个结合DNA的珠子置于 PicoTiterPlate(PTP)光纤芯片上的直径约29微米孔内,每孔一个珠子。DNA聚合酶, sulfurylase和荧光素酶同时封 装在小孔内。
           该PicoTiterPlate被放入GS-FLX 系统进行测序。454测序仪可以测定任何序列的双链DNA,适用于全基 因组测序,基因组序列重测序,RNA分析等。

    样品要求
    ★ DNA样品:必须是双链DNA; OD260/280比值在1.8~2.0之间 (纯度越高越好); 浓度 ≥ 100 ng/μl (浓度越高越好); 长度 > 1.5 kb (长度越长越好); 总量大于2μg,越多越好;
    ★ mRNA样品:总量大于1μg; 浓度大于20ng/μl (浓度越高越好); OD值260/280比值在1.8~2.2之间 (纯度越高越好,不含DNA); 长度越长越好,mRNA正常应分布在0.2 kb 到 7 kb之间;
    ★ 总RNA样品:(需要咨询); 总量大于1mg;浓度大于1000ng/μl; OD值260/280比值在1.8~2.2之间;长度越长越好;

    最终产品
      原始序列数据和质量数据,总reads数目和平均长度及分 布图,总bp数目;个体化分析需要协商。
    1)测序数据;
    2)分析结果(生物信息学分析结果, 包括:Nt、Nr、Swissprot、KEGG等注释结果, COG或GO分类等);
    3)详细的实验报告。
     
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