服务名称: | Solexa测序 |
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标凯科技自2009年9月起联合北京市超算中心、北京市理化分析测试中心开展第二代大通量测序和数据分析服务。我们依托Solexa测序仪和高达20万亿次每秒的服务器给客户提供一个高通量、高质量的测序平台和信息分析平台,为科研人员提供Solexa测序服务。运用第二代Illumina Genome Analyzer系统(GA II),让您在最短的时间内获得最多的高质量数据。相比于第一代Genome Analyzer系统,新一代GA II系统中每个通道的面积在原有基础上扩展了40%,即通量提高了40% 。升级后的系统一个通道单次运行就可以获得超过1000万个读数(read)。
样品要求
DNA浓度≥100ng/µl、总量≥30μg;
DNA样品260/280比值在1.8~2.0之间,电泳主带应在20Kb以上且主带清晰,无弥散;
RNA浓度≥400ng/µl, 总量≥30µg;
总RNA OD值260/280为1.8~2.2,完整性良好,如使用Agilent Bioanalyzer仪器检测,则获得的总RNA应28S:18S≥1.5,RNA≥8。
服务流程
1、文库制备
· 样品收集,基因组DNA打断;
· DNA 末端修复;
· 连接接头;
2、DNA片段在Cluster Station上成簇扩增
· 准备Flowcell和试剂,安装到Cluster Station;
· 将样品DNA连接到Flowcell;
· 完全自动化完成Cluster制备;
3、DNA簇在Genome Analyzer上边合成边测序
· 将Flowcell和试剂,安置到Genome Analyzer;
· 全自动化完成测序,包括测序长Reads;
· 图片处理,实时分析,碱基识别;
4、Paired-End Module
· 附加组件用于自动化运输试剂;
· Paid-End 中Read 2测序的前期准备;
5、数据分析
基因分析:图片分析、碱基识别、序列分析和序列组装;
变异分析:单核苷酸多态性、短片段插入/缺失以及结构性
变异;基因组注释;
比较基因组及分子进化分析;
转录本结构及基因转录水平的研究及比较;
总结报告;
文库制备试剂盒8道 flowcell
Cluster Station 簇生成仪
Paired-End Module
对读模块
荧光图片结果
最终产品:
原始序列数据和质量数据;
个体化分析需要协商。