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| 规格： | 样本 |
活动说明
历时多年的技术经验积累，国内外借助PacBio三代测序技术于细菌基因组学研究领域发表的论文已有数百篇，为了让中国科研者更好地完成科研项目，天津生物芯片现限时推出细菌基因组PacBio三代测序优惠大放送活动。
细菌基因组通常比较小，大多在5MB以内，建议采用Pacbio RS II平台测1个SMRT Cell，获得800Mb-1.4Gb的数据，然后对于三代测序数据进行单独组装获得基因组完成图。三代测序平台的错误在于随机误差，因此可通过增加数据覆盖度显著降低错误率。
根据Pacbio官方提供的参考标准，细菌/真菌基因组覆盖大于80×,碱基准确度已接近99.99999%(QV70),即相当于每一千万个碱基中约发生一个碱基错误。以上研究方案在碱基准确度、基因组覆盖及组装结果方面均可获得较好结果。
技术优势
1，无GC偏好，对于GC%正常菌株和GC%异常菌株，Pacbio RS II 平台均可获得高质量测序数据；
2，可获得0 gap 基因组完成图，1个contig=1条染色体；
3，对于包含质粒的菌株，不仅可获得完整的细菌基因组，还可同时获得完整的质粒基因组序列。
成功案例
2016年，天津生物芯片利用PacBio RS II平台，对GC含量高达70%的细菌进行了基因组完成图测序，仅用了1个cell测序，获得了超过1.2Gb的测序数据，实现该菌基因组200X以上测序覆盖，随后利用天津生物芯片自主研发软件进行De novo拼接，最终获得高准确性的基因组完成图。
关于TBC
2013年，天津生物芯片率先在国内提供PacBio RS II三代测序服务，天津生物芯片已积累丰富的项目经验，成为中国三代测序技术应用的领跑者。2016年，天津生物芯片引进最新的美国三代测 序平台Sequel，以满足呈指数增长的三代测序服务需求，从而继续领跑中国三代测序服务市场。截止目前，公司在Nature、Nature Communications、PNAS等杂志累计发表SCI论文超过130篇，总影响因子超过500。
问题解答
1、细菌完成图用第三代单分子测序Pacbio RS II平台还是SEQUEL 平台？
答：SEQUEL 单个CELL数据量大约5G，RS II单个CELL数据量1G，而细菌的话1G数据量足够完成图了。从技术上说，都可以，从成本上RS II更合适。
2、第三代单分子测序平台的单碱基准确率低，如何保证拼接结果的准确性？
答： 第三代单分子测序平台的结果为单分子测序的结果，单碱基准确率仅为 87%，但其测序错误无偏好性，通过对某一个碱基的高覆盖，拼接结果的准确率可以达到 99.9% 以上。后续我们进一步利用高准确率的二代测序数据对拼接结果进行校正，确保最终拼接结果的准确率达到99.99% 以上。
3、项目周期以及工作日如何保证？
答： 微生物基因组测序完成图为 20个个工作日。我们的工作日一般都是从样品提取检测合格的日期开始计算。个性化分析内容的项目周期需要视具体情况而定。
项目联系方式
天津生物芯片技术有限责任公司
地址：天津经济技术开发区海云街80号融通大厦A座B2-3
电话：022-66229538 传真：022-66226983
邮箱：tjbiochipmk@126.com QQ:2869494262
注：本活动最终解释权归天津生物芯片所有
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