DNA甲基化测序数据（MeDIP-seq）其他个性化分析服务_生物信息学_分子生物学服务_技术服务库_商城

提供商：	湖南科互生物医药有限公司
服务名称：	DNA甲基化测序数据分析

服务项目

DNA甲基化作为表观遗传修饰的主要方式，它不改变DNA的一级结构，却在细胞的发育、基因的表达、及基因组的稳定性中起着重要的作用。

本公司可完成完整的DNA甲基化芯片分析流程:
1. DNA甲基化数据标准化分析：对不同平台DNA甲基化芯片原始数据处理、标准化、信号提取，物种不限。
2. 甲基化的染色体分布图：甲基化在各个染色体的分布情况
3. DNA甲基化聚类图：为了展示甲基化水平在样本中高低甲基化的分布，用甲基化水平的值来做聚类/热图的展示。
4. 差异甲基化基因的功能分析（GO分析）：GO-Analysis对差异甲基化基因等按GO分类，并对分类结果进行基于离散分布的显著性分析、误判率分析、富集度分析，得出与实验目的有显著联系的、低误判率的、靶向性的基因功能分类，该分类即导致样本性状差异的最重要的功能差别。通过该分析有可能找到导致甲基化水平变化的重要功能，并且找到该功能所对应的基因。
5. 差异甲基化基因的通路（pathway）分析：信号通路（Pathway）是多个蛋白质间相互作用，共同调节细胞功能和代谢活动的过程。而信号通路分析是通过对差异基因按照Pathway的主要公共数据库KEGG和Biocarta来进行分类，对Pathway中的基因进行基于离散分布的显著性分析，得到与实验目的有显著联系的Pathway 分类,该分类即导致样本性状差异的最重要Pathway。
6. 转录因子预测分析：通过对差异甲基化区域转录因子的预测，得到调控甲基化的转录因子。
7. 甲基化芯片与表达谱芯片联合分析：通过与基因表达谱进行联合分析，采用cross_plot来展示甲基化与mRNA层面的相关性，找到与甲基化负相关的mRNA。

技术展示

文献：《DNA-methylation in C1R is a prognostic biomarker for acute myeloid leukemia 》
期刊：《Clin Epigenetics》
IF值：4.987

文献：《Integrated analysis of DNA methylation and mRNA expression profiling reveals candidate genes associated with cisplatin resistance in non-small cell lung cancer》
期刊：《Epigenetics》
IF值：4.394