提供商: | 湖南科互生物医药有限公司 |
服务名称: | RNA数据通路富集 |
服务项目分析内容
富集分析是对基因功能及其表达进行分析的一种方式。通过富集分析,能够对基因的功能有更进一步的了解
通路富集分析:目前,KEGG是有关Pathway的主要公共数据库。根据挑选出的差异基因,计算这些差异基因同Pathway 的超几何分布关系,Pathway 分析会对每个有差异基因存在的pathway 返回一个p-value,小的p 值表示差异基因在该pathway 中出现了富集,并计算误判率。Pathway 分析对实验结果有提示的作用,通过差异基因的Pathway 分析,可以得到与主流表达趋势相关的所有基因参与的显著、靶向的Pathway,寻找不同样品的差异基因可能和哪些细胞通路的改变有关,同时将上下调的差异基因映射到每一个pathway map上,定位关键通路的关键基因。
GO富集分析:Gene Ontology可分为分子功能(Molecular Function),生物过程(biological process)和细胞组成(cellular component)三个部分。蛋白质或者基因可以通过ID对应或者序列注释的方法找到与之对应的GO号,而GO号可对于到Term,即功能类别或者细胞定位。通过富集分析可以找出在统计上显著富集的GO Term。该功能或者定位有可能与研究的目前有关。通过GO分析能够更近一步了解基因的潜在功能。
Pathway crosstalk分析:Pathway 分析对实验结果有提示的作用,通过差异基因的Pathway 分析,可以找到富集差异基因的Pathway 条目,寻找不同样品的差异基因可能和哪些细胞通路的改变有关。而不同的pathway之间可能存在互相的影响。该分析能够找出不同通路之间的潜在相互作用,为更加深入的了解基因功能及pathway的作用提供基础。并且可以进行Network构建,帮助用户快速定位基因的功能和其参与的信号通路,并进行清晰直观的展示。
个性化服务:我们可以对客户提出需求进行有针对性的服务。可以对测序数据集的差异基因,蛋白进行上述分析,并构建相关network网络图。此外,也能针对性的对RNA数据进行分析,对RNA的潜在靶标基因进行相关富集分析,从而进一步了解RNA功能。
期刊:《Chinese Journal of Cancer》
IF值:4.111
文献:《An integrated analysis based on transcriptome and proteome reveals deastringency-related genes in CPCNA persimmon.》
期刊:《Scientific Reports》
IF值:4.259
通路富集分析:目前,KEGG是有关Pathway的主要公共数据库。根据挑选出的差异基因,计算这些差异基因同Pathway 的超几何分布关系,Pathway 分析会对每个有差异基因存在的pathway 返回一个p-value,小的p 值表示差异基因在该pathway 中出现了富集,并计算误判率。Pathway 分析对实验结果有提示的作用,通过差异基因的Pathway 分析,可以得到与主流表达趋势相关的所有基因参与的显著、靶向的Pathway,寻找不同样品的差异基因可能和哪些细胞通路的改变有关,同时将上下调的差异基因映射到每一个pathway map上,定位关键通路的关键基因。
GO富集分析:Gene Ontology可分为分子功能(Molecular Function),生物过程(biological process)和细胞组成(cellular component)三个部分。蛋白质或者基因可以通过ID对应或者序列注释的方法找到与之对应的GO号,而GO号可对于到Term,即功能类别或者细胞定位。通过富集分析可以找出在统计上显著富集的GO Term。该功能或者定位有可能与研究的目前有关。通过GO分析能够更近一步了解基因的潜在功能。
Pathway crosstalk分析:Pathway 分析对实验结果有提示的作用,通过差异基因的Pathway 分析,可以找到富集差异基因的Pathway 条目,寻找不同样品的差异基因可能和哪些细胞通路的改变有关。而不同的pathway之间可能存在互相的影响。该分析能够找出不同通路之间的潜在相互作用,为更加深入的了解基因功能及pathway的作用提供基础。并且可以进行Network构建,帮助用户快速定位基因的功能和其参与的信号通路,并进行清晰直观的展示。
个性化服务:我们可以对客户提出需求进行有针对性的服务。可以对测序数据集的差异基因,蛋白进行上述分析,并构建相关network网络图。此外,也能针对性的对RNA数据进行分析,对RNA的潜在靶标基因进行相关富集分析,从而进一步了解RNA功能。
技术展示
文献:《GOMA: functional enrichment analysis tool based on GO modules》期刊:《Chinese Journal of Cancer》
IF值:4.111
文献:《An integrated analysis based on transcriptome and proteome reveals deastringency-related genes in CPCNA persimmon.》
期刊:《Scientific Reports》
IF值:4.259
服务流程
公司承诺
诚信服务:正规发票开具、合作协议签订
信息保密:严格杜绝您的项目信息泄露,如有泄露,3倍服务金额赔付
实时跟进:项目进度及时汇报,让用户清楚项目的每一步
售后无忧:如果项目有问题,我们将负责到底
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官方网站:www.scirplus.com
咨询热线:400-1515-810
电子邮件:scirplus@vip.qq.com
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