非靶向代谢组学(untargeted metabolome)
非靶向代谢组学也叫发现代谢组学:
发现代谢组学一般包括:
1代谢谱分析(也称为差异表达分析),在一组实验和对照样品中,寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物
2鉴定,进行代谢谱分析后,测定这些代谢物的化学结构
3解释,研究流程的最后一步,解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联
分析流程
生物信息分析
生物信息学分析
基础服务包 | |
1. 原始数据Peak提取及保留时间纠正 | 2. 多样本Peak比对(peak alignment) |
3. 缺失值模拟 | 4. 显著性差异Peak分析 |
基础分析包(统计分析) | |
1.主成分分析(PCA) | 2.偏最小二乘法判别分析(PLS-DA) |
3.热图分析 | 4.K-means聚类分析 |
5.决策树分类分析 | 6.ROC判别分析 |
增殖分析包(功能分析) | |
1. Peak代谢组注释 | 2. Pathway注释 |
增殖分析包(关联分析) | |
1. 代谢组与转录组关联分析 | 2.代谢组与蛋白组组关联分析 |