代谢组学服务UPLC­­­---Q-TOF LC/MS

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更新: 2021-05-27
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提供商: 西农生(北京)生物技术有限公司
服务名称: 代谢组学服务UPLC­­­---Q-TOF LC/MS

                                                代谢组学服务UPLC­­­---Q-TOF LC/MS 
 
声明:为保护客户的权益与保密协议,在保证实验结果真实有效的前提下,我们对实验的数据进行了适当的变动处理,简化了实验流程及采样数量。请勿转载!责任自负!
 
使用仪器:液-质联用
UPLC­-----Agilent 1290

Q-TOF LC/MS------Thermo Orbitrap Elite( 分辨率> 240,000 FWHM) 或AB Triap 5600+

 
样品信息:
患病组血清样品vs.对照组血清样品
 
实验流程
通过UPLC­­­----Q-TOF LC/MS分析,分析患病组和对照组血清样品代谢成分,获得代谢组分的实验数据。利用数学分析方法寻找患病组和对照组中具有差异性的代谢组分,建立未知样本分析模型。
 
实验步骤:
 

一、采样
对样本来源进行分组,并记录性别、年龄、病情、治疗等信息;
采集全血,离心后获得血浆/清样本,于-80℃冰箱中保存。

血浆/清样本用提取液沉淀蛋白,并于-20℃下提取化合物1 h;高速离心后取上清液,经真空抽干后复溶于甲醇溶液。


二、仪器分析及数据预处理(信息峰的提取和识别)


图一  人血清样品典型的LC/MS总离子流图(TIC, ESI+,m/z 60–1000.)



三、数据分析

 
图二:主成分(PCA)得分图:每个点代表一个样本,对照组和患病组样本在CA空间可以明显的分为两组


  
图三:   偏最小二乘法判别分析3D PLS-DAS-Plot),寻找候选生物标志物,可用疾病诊断和模型识别



四、差异代谢物鉴定

图四:高分辨率MS/MS鉴定,右图是左图(一级质谱结果)单峰的二级质谱结果

 


另:生物信息学服务内容:后期数据分析及挖掘
 
 A、疾病识别,诊断模型
 
 B、系统生物学分析

图五:疾病潜在生物标志物的代谢通路分析,阐释发病机制和生命现象

详见公司网站 http://www.scilongs.com