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| 提供商： | 上海吐露港生物科技有限公司 |
| 服务名称： | 细菌基因组测序 |
| 规格： | 细菌基因组（<5M) |
细菌基因组测序
服务简介
随着新一代测序技术的迅猛发展，全基因组测序已经成为细菌基因组研究不可或缺的重要工具。下一代高通量测序技术大大降低了细菌基因组研究的成本，缩短了研究周期，为越来越多的实验室提供了细菌基因组研究的便利。吐露港生物科技采用PacBio平台结合Illumina测序平台，可以提供高效、快速、廉价的细菌基因组完成图。
服务类型
根据不同的研究目的和需求，吐露港提供以下3类服务供选择：
（1）细菌精细图：采用大片段加小片段建库，然后利用Illumina HiSeq2500深度测序和初步的基因组组装策略，性价比高，满足细菌基因组研究基本需求。
（2）细菌完成图：综合利用PacBio RSII（第三代单分子实时荧光测序技术）结合Illumina HiSeq2500深度测序，根据菌株具体情况制定最优策略，最终得到一条完整的基因组序列（补齐所有的gaps）。
（3）细菌重测序：针对已知基因组序列的细菌，采用HiSeq深度测序，后续分析不依赖于组装，关注基因组变异情况（包括SNP和InDel等），是群体研究的首选。
服务流程
收费标准
| 测序项目 | 费用（RMB） | 周期（工作日） |
| 细菌精细图 | 1.6万（基因组< 5M)；2.2万（基因组>5M） | 30 |
| 细菌完成图 | 3.0万（基因组< 5M)；4.5万（基因组>5M） | 50 |
| 细菌重测序 | 0.2万/1M基因组 | 20 |
| 数据分析 | 费用（RMB） | 周期（工作日） |
| 1. 基因预测 | 150（对于选择测序服务客户，免费） | 5 |
| 2. 功能注释 | 150（对于选择测序服务客户，免费） | 5 |
| 3. COG分类 （默认COG数据） | 150（对于选择测序服务客户，免费） | 5 |
| 4. 代谢通路构建 （默认KEGG数据库） | 150（对于选择测序服务客户，免费） | 5 |
| 5. tRNA、rRNA预测 | 150（对于选择测序服务客户，免费） | 5 |
| 6. 基因组岛预测 （只针对完成图） | 200 | 5 |
| 7. 蛋白亚细胞定位 | 200 | 5 |
| 8. 比较基因组学分析 8.1 SNP分析 8.2 Indel分析 8.3 Pan-genome分析 8.4 基因组结构分析 （8.4只针对完成图） | 600 | 5 |
| 9. 次生代谢基因簇分析 （只针对完成图） | 400 | 5 |
| 10. 基因组圈图绘制 （只针对完成图） | 400 | 5 |
| 11. 进化树分析 （客户提供≥2个参考基因组链接） | 200 | 5 |
对于所有数据分析（单选或全部），均在5个工作日内完成。
通过徐汇区市场监督管理局认证 
