• 游客
收藏 | 举报 2009-07-03 12:45   关注:228   回答:32

【讨论】慢病毒载体 感染 目的细胞[精华]...

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【讨论】慢病毒载体 感染 目的细胞[精华]

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  • 游客
举报 2009-07-09 06:07
楼主看来是需要先好好补习一下分子生物学的基础,分清楚针对不同细胞的不同耐药基因(比如像Amp,Kana对原核;Neo, Puro对真核等等,推荐好好看看分子克隆,呵呵)。根据你的实验目的,如果要筛选整合到基因组的细胞,你可以利用Neo,Puro的药物筛选,也可以利用GFP,YFP,m-Cherry的荧光筛选!
关于慢病毒包装过程,现在iPSC研究如火如荼,随便一篇好的paper都会提到Lenti/Retroviral转染系统,个人推荐好好看看最先发在Nat. Biotech那篇详细介绍lentiviral的文章。大概的过程gongtj战友已经介绍过了,补充几点:
1.转染细胞推荐用293T/FT,方法用脂质体或磷酸钙皆可;
2. 细胞接种密度过大或过稀皆不好;
3. Transfection过程最好在8-16小时之间,千万不能太长,否则滴度直线下降;
4. 换液时需特别小心,尽可能轻柔且迅速,经过transfection后的细胞非常脆弱,稍不留神很容易detach,这是我血的经验和教训;
5. 收集上清时间因人而异,我一般是收转染后48和64小时2次,结果不错,当然有的人可以从24一直收到72,这需要你自己摸索;
6.是否需要超速离心浓缩病毒取决于你的目的,浓缩可以提高滴度,但步骤麻烦且需特别小心,不提倡初学者使用,我一般不经浓缩的病毒上清最后也能接近10的7次方左右,做绝大部分的实验已经绰绰有余了,一味盲目地追求滴度最终来可能两手空空;
7.关于滴度的检测,比较精确的就是用不同稀释比例的病毒上清去感染(infection)293T/FT细胞(这个质粒需要带荧光标记),24-48小时上流式检测,再根据公式计算。
说了这么多,都是自己做病毒1年多的一些心得体会,以求抛砖引玉,版上肯定还有很多高人,只是没有露面而已,祝你好运,呵呵!
  • 游客
举报 2009-07-10 17:52
楼上说的很明白了。我再罗嗦几句。
公司做好的质粒你回来要在原核中(E.coli)扩增备份的,否则几次就用完了啊!AmpR是为了让你在原核里面扩增质粒时候用的筛选抗性。
扩增好留有备份后就可以转染目的细胞了。这时候需要有Neo, Puro或荧光表达进行筛选。
这是两类不同目的的和用途的筛选。
  • 游客
举报 2009-07-07 20:44
我想lz是搞错了一个问题:
在慢病毒包装的过程中,不需要通过AmpR来筛选阳性颗粒。
AmpR的作用仅是Allows selection of the plasmid in E. coli。
AmpR不会被重组到Lentiviral vector中,后面如果要检测是否整合到细胞基因组,可以通过GFP。

以(pMDL, pRev and pVSVG)系统为例,病毒包装的过程大概如下:
Day 1: Seed cells
Day 2: Transfect cells
Day 3: Change media
Days 4 and 5: Collect supernatant
Day 6: Concentrate the viral preparation
Day 7: Purify the viral preparation through a sucrose cushion
Days 8–11: Titer the viral suspension
  • 游客
举报 2009-07-06 02:40
楼主看来是需要先好好补习一下分子生物学的基础,分清楚针对不同细胞的不同耐药基因(比如像Amp,Kana对原核;Neo, Puro对真核等等,推荐好好看看分子克隆,呵呵)。根据你的实验目的,如果要筛选整合到基因组的细胞,你可以利用Neo,Puro的药物筛选,也可以利用GFP,YFP,m-Cherry的荧光筛选!
关于慢病毒包装过程,现在iPSC研究如火如荼,随便一篇好的paper都会提到Lenti/Retroviral转染系统,个人推荐好好看看最先发在Nat. Biotech那篇详细介绍lentiviral的文章。大概的过程gongtj战友已经介绍过了,补充几点:
1.转染细胞推荐用293T/FT,方法用脂质体或磷酸钙皆可;
2. 细胞接种密度过大或过稀皆不好;
3. Transfection过程最好在8-16小时之间,千万不能太长,否则滴度直线下降;
4. 换液时需特别小心,尽可能轻柔且迅速,经过transfection后的细胞非常脆弱,稍不留神很容易detach,这是我血的经验和教训;
5. 收集上清时间因人而异,我一般是收转染后48和64小时2次,结果不错,当然有的人可以从24一直收到72,这需要你自己摸索;
6.是否需要超速离心浓缩病毒取决于你的目的,浓缩可以提高滴度,但步骤麻烦且需特别小心,不提倡初学者使用,我一般不经浓缩的病毒上清最后也能接近10的7次方左右,做绝大部分的实验已经绰绰有余了,一味盲目地追求滴度最终来可能两手空空;
7.关于滴度的检测,比较精确的就是用不同稀释比例的病毒上清去感染(infection)293T/FT细胞(这个质粒需要带荧光标记),24-48小时上流式检测,再根据公式计算。
说了这么多,都是自己做病毒1年多的一些心得体会,以求抛砖引玉,版上肯定还有很多高人,只是没有露面而已,祝你好运,呵呵!
  • 游客
举报 2009-07-07 08:33
谢谢楼上的回复。
我确实是在恶补分子生物学知识;
另外,我所用的病毒颗粒是公司已构建好的,用于感染成纤维细胞,苦于不明白AmpR 的具体作用。
那么,根据楼上所说,我所有的目的基因过表达病毒颗粒不带有GFP,又无抗性基因,那就无法对感染后的细胞进行筛选了。
  • 游客
举报 2009-07-14 19:17
哎!汗啊~!你用来做transfection的plasmid怎么去amplify呢?还不是要先在菌里面扩起来嘛!没有荧光标记,又没有抗性基因,貌似是不好筛选。。。你自己就不会插一个进去啊?!这么简单的事情,两顿饭的功夫而已嘛!
罚你,每晚上床之前,捧着分子克隆,面壁思过一小时!以后就不会再问这些问题了:)
  • 游客
举报 2009-07-05 04:46
晕菜!!!
我是说,病毒已包装构建好,公司做的。

那 我现在能做什么?越来越糊涂了。
  • 游客
举报 2009-07-10 05:29
lz,如果公司已帮你包装好病毒,那你可以直接拿去用了呗,感染目的细胞啊。
  • 游客
举报 2009-07-12 16:19
就三张图谱啊?
  • 游客
举报 2009-07-12 02:53
第一,你载体够好了,应该放在受体菌里面扩大,提取质粒。
第二,那个amp是为了让你在原核里面扩增质粒时候用的抗性。
第三,抽取好的质粒,就可以包装病毒了,需要荧光标记来检测转染情况,如果没有,需要对载体再进行改造。
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