• 游客
收藏 | 举报 2009-06-17 09:18   关注:233   回答:10

【求助】做RNA干扰,为什么有人用2种载体,有人从头到尾只用...

已解决 悬赏分:0 - 解决时间 2024-11-22 05:05
【求助】做RNA干扰,为什么有人用2种载体,有人从头到尾只用1种?

我来回答
  • 游客
举报 2009-06-21 18:03
希望各位大大不吝赐教啊
  • 游客
举报 2009-06-25 08:54
希望各位大大赐教啊
  • 游客
举报 2009-06-20 18:11
在线等
  • 游客
举报 2009-06-18 23:50
我也很想知道,请懂的战友指教撒
  • 游客
举报 2009-06-17 21:17
友情帮顶~~~
  • 游客
举报 2009-06-25 13:49
我也很想知道
  • 游客
举报 2009-06-22 06:44
对于一些难以转染或者转染率达不到RNAi要求(一般要求>50%), 如HepG2,利用病毒侵染是一个很省事的手段,至少你不用去利用抗性筛选了,而且病毒包装好之后,侵染实验在手时间非常短,在MOI合适的前提下,对细胞的损伤会比较小;
对于一些需要观察长期或晚期性状的实验,利用病毒导入shRNA转录框,knockdown的效应期一般长于直接质粒转染。
此外特别对于腺病毒和腺相关病毒,由于它们插入宿主基因组的概率低,因此可以减少插入突变的可能,是目前人类基因治疗的最可能的安全载体。当然不同的病毒载体各有各的好处和缺点,lz可以关门查查看。
当然不是说用病毒就需要两步克隆,现在也有直接可以克隆shRNA表达框的前病毒载体,但在买不到或者shRNA载体和前病毒载体都有的情况下,随便改造一步费不了多大事儿吧。
  • 游客
举报 2009-06-26 02:42
你说的第一种情况,一般是用的真核表达载体,就是直接用质粒转染细胞,做RNA干扰。这种方法成本较低,在目的细胞的质粒转染效率比较高的情况下,shRNA的表达量也可以。但是,它有个前提,就是“目的细胞的质粒转染效率比较高”,而实际上,有很多种细胞的质粒转染效率都不是很高的。这时候,就要用到病毒载体了,例如腺病毒载体或者慢病毒载体,就是第二种情况。腺病毒其实也是瞬时表达,成本也比做质粒要高,但是除了有限的几种细胞外,基本不用太考虑腺病毒感染细胞的效率问题,很省事,效果也不错。慢病毒则是通过整合,能够长期表达shRNA,这是它的一大优点,不过慢病毒的生物安全性是它最大的软肋。
所以,如果你要选择用什么载体,你的实验预算最重要,呵呵。如果实验经费充足,那么用腺病毒或者慢病毒当然最好。如果实验经费不太够,而目的细胞的质粒转染效率又比较高的话,那就用质粒,做一个腺病毒的钱足够你做好几个质粒了。不过如果目的细胞质粒转染效率比较低,那么,你还是选腺病毒或者慢病毒吧,除非你换目的细胞。要不就做稳定性筛选,不过这实验非常麻烦,你还不如多花点钱去做腺病毒或者慢病毒。
  • 游客
举报 2009-06-21 19:15

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hustokyo
你说的第一种情况,一般是用的真核表达载体,就是直接用质粒转染细胞,做RNA干扰。这种方法成本较低,在目的细胞的质粒转染效率比较高的情况下,shRNA的表达量也可以。但是,它有个前提,就是“目的细胞的质粒转染效率比较高”,而实际上,有很多种细胞的质粒转染效率都不是很高的。这时候,就要用到病毒载体了,例如腺病毒载体或者慢病毒载体,就是第二种情况。腺病毒其实也是瞬时表达,成本也比做质粒要高,但是除了有限的几种细胞外,基本不用太考虑腺病毒感染细胞的效率问题,很省事,效果也不错。慢病毒则是通过整合,能够长期表达shRNA,这是它的一大优点,不过慢病毒的生物安全性是它最大的软肋。
所以,如果你要选择用什么载体,你的实验预算最重要,呵呵。如果实验经费充足,那么用腺病毒或者慢病毒当然最好。如果实验经费不太够,而目的细胞的质粒转染效率又比较高的话,那就用质粒,做一个腺病毒的钱足够你做好几个质粒了。不过如果目的细胞质粒转染效率比较低,那么,你还是选腺病毒或者慢病毒吧,除非你换目的细胞。要不就做稳定性筛选,不过这实验非常麻烦,你还不如多花点钱去做腺病毒或者慢病毒。

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非常感谢!我今天又问了问基础实验室的老师,和你说的大概差不多,呵呵,真的非常感谢!我经费前期花的有点多,估计要用第一种方法了。哎,这也是没有办法的办法了
  • 游客
举报 2009-06-19 07:04

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zhanggongdoctor
各位大大,你们好,我现在准备做siRNA,好多东西都不懂。看了一些文章,对一些问题有疑惑,希望能得到解答。我看到的文章都是用siRNA技术阻断某个癌细胞中某个基因的表达,但是发现分2种情况:

1.有的人做实验从头到尾都是用的一个载体,如RNAi-Ready pSIREN-RetroQ,都是和互补的寡核苷酸双链重组连接后,鉴定一下,就可转染癌细胞了;

2.有的人做实验用的载体较多,比如先用pSiren-Shuttle和双链的寡核苷酸连接,然后经霜酶切,亚克隆入pAdeno腺病毒载体,然后用HEK293细胞进行包装及扩增,这以后才转染癌细胞;

不知道这两种方法有什么区别,那种好,那种不好?为什么有的用一个载体重头到尾,而有的却用2个这么多?而且第一种的步骤好像省略了很多,不知道有没有影响?不知哪位大大能详细解释一下,谢谢啊!

......



两种不同的方法,一种是逆转录病毒一种是腺病毒。具体方法的选择没有那么简单,要全方位考虑。建议将课题说清楚,可以发邮件与我交流!