• 游客
收藏 | 举报 2008-05-28 10:01   关注:201   回答:12

【求助】RNA干扰载体连接...

已解决 悬赏分:0 - 解决时间 2024-11-22 04:15
【求助】RNA干扰载体连接

我来回答
  • 游客
举报 2008-06-07 01:59

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anlong
急啊!我用别人已经插入目的片段的RNAi-Ready pSIREN-RetroQ-ZsGreen质粒做了双酶切(EcoRⅠ和 BamH Ⅰ),然后连自己的目的片段,快做了一个月了,一直长不出单克隆来,郁闷

目的片段是自己设计合成的两条寡核苷酸链退火得到的,条件是100μM的单链各1μl,补8μl水至10μl体系,95° 30S, 72°2min,37° 2min,25° 2min, 4° 30min。(因为片段只有60多个BP,而且是合成的,所以量少,不好鉴定是否退火成功。。)

连接用的是TAKARA的Solution Ⅰ溶液,连接时间从3小时到过夜都试过,16°

我怕shRNA单链发卡结构太严重,甚至试了下DMSO,但还是不成,实在找不出原因了,哪位大虾帮我看看啊,感激不尽!!!

......



跑PAGE胶看看引物质量以及退火效率。
  • 游客
举报 2008-05-30 01:09
刚跑了个琼脂糖电泳,100以下倒是有带,但已经很模糊了,没法判断多大,可以确定是退火产物么?
如果没有形成双链应该不显色吧
  • 游客
举报 2008-06-06 22:33
我们自己也做过很多个质粒了,感觉一般片段退火这一步没啥问题。建议首先排除你载体的问题,如载体是否正确,酶切位点选择是否合理,载体回收后的可用于连接的活性(找个从其它载体上切下来的片段作为连接的阳性对照试试)。
  • 游客
举报 2008-05-31 05:50
hehwei
我们自己也做过很多个质粒了,感觉一般片段退火这一步没啥问题。建议首先排除你载体的问题,如载体是否正确,酶切位点选择是否合理,载体回收后的可用于连接的活性(找个从其它载体上切下来的片段作为连接的阳性对照试试)。

恩,谢谢,我试试看
  • 游客
举报 2008-06-07 12:05
做的怎么样了????
  • 游客
举报 2008-06-04 16:13
能把载体单酶切和双酶切的电泳图放上来吗
  • 游客
举报 2008-05-30 08:08
丁香海豚
做的怎么样了????

还是没进展,小片段大载体就这么难连吗?你的实验怎么样了?
  • 游客
举报 2008-06-07 07:12
snooppyyy
能把载体单酶切和双酶切的电泳图放上来吗

因为载体6600bp,片段60个Bp,所以切出来单切和双切看着一样大,但单切都能切开,我估计切好的载体应该没什么问题吧
图当时没有保存
  • 游客
举报 2008-05-31 15:27
anlong
还是没进展,小片段大载体就这么难连吗?你的实验怎么样了?


我从新做批感受态,估计是它出了问题,
今天又重新退火了一批oligo,
今天晚上再连~
我就不信,做不出来
你也别灰心~
  • 游客
举报 2008-05-28 17:02
要验证感受态你转个带抗性的未切质粒就可以了
我再换个大点的插入片段试试。
一起加油吧
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