培训大纲：
一 、分子鉴定的应用
1、微生物、动物、植物资源普查
2、检验检疫
3、中药材真伪鉴定
4、食品质量安全
5、疾病诊断和预防
6、分子育种
二、DNA 测序技术-遗传检测的利器
1、第一代测序技术：Sanger 测序原理
2、第二代测序技术：Illumina，454, Ion Torrent 原理
3、第三代测序技术：PacBio, Hellicos 原理
4、第四代测序技术:Oxford NanoPore 原理
5、Hybridization based methods6、测序技术的比较及展望
三、Sequence-independent 分子标记的开发及应用
1、Restriction fragment length polymorphism（RFLP）
2、Random amplified polymorphic DNA（RAPD）
3、Simple sequence repeats（SSR）
4、Single strand conformation polymorphism（SSCP）
5、Cleaved amplified polymorphic sequence（CAPS）
6、Sequence characterized amplified region（SCAR）
7、Amplified fragment length polymorphism（AFLP）
8、Inter-retrotransposon amplified Polymorphism（IRAP）
9、REtransposon-microsatellite amplified polymorphism（REMAP）
四、equence-dependent 分子标记开发及应用
1、常用的 DNA 条形码标记：ITS，ITS1，ITS2，trnH-psbA，rbcL-matK，COI 等
2、常用 DNA 条形码鉴定方法：sequence similarity-based（Blast， Hidden Markov Model），tree-based，cutoff-based
3、筛选最优 DNA 条形码指标
⑴PCR amplification success
⑵Sequencing efficiency
⑶Species distinguishing power
⑷DNA barcoding gapDNA barcoding 相关数据库
⑴BOLD: Barcode of Life Database
⑵BOMMD: Barcode of Medicinal Materials Database
五、基于全基因组序列的新的分子标记的发现
1、（真菌、动物）线粒体基因组⑴测序方案: 实验方法纯化还是生信方法纯化⑵组装方法：de novo vs. reference based⑶注释流程: MFAnnotator vs. FUMGA⑷特异性标记筛选流程
2、（植物）叶绿体基因组⑴测序方案：实验方法纯化还是生信方法纯化⑵组装方法：de novo vs. reference based⑶注释流程：CPGAVAS vs. DOGMA⑷特异性标记筛选流程
六、物理图谱和遗传图谱构建新方法：
原理及应用 1、Optical Map
2、Bionano
3.reduced-representation sequencing using reduced-representation libraries (RRLs)
4、complexity reduction of polymorphic sequences (CRoPS),
5、Restriction-site associated DNA sequencing（RAD-Seq）
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报名参会，可以将报名回执表填好，发送到会务组邮箱。
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